RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462219.5

LINC00879-201, long intergenic non-protein coding RNA 879, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00879, Length 695 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00879-201ENST00000462219 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 TPH2Q8IWU9 490 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 LINC01465Q8N7H1 131 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 NEK9Q8TD19 979 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 USP28Q96RU2 1077 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 PP2D1A8MPX8 630 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 BRD1O95696 1058 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 SELPP16109 830 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 RPA1P27694 616 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 THPOP40225 353 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 NPEPPSP55786 919 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 GRIN1Q05586 938 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 MBTPS1Q14703 1052 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 ECM1Q16610 540 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 FAM26DQ5JW98 314 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 TMEM199Q8N511 208 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 RETREG2Q8NC44 543 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 A0A087WWV3 80 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 NBNO60934 754 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 CAND2O75155 1236 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 BMP15O95972 392 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 CHRNA1P02708 482 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 CDC25AP30304 524 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 DDIT3P35638 169 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 MGAT3Q09327 533 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 MTERF2Q49AM1 385 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 IL23AQ9NPF7 189 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 MAGEB2O15479 319 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 MAFO75444 373 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 RSPH10BP0C881 870 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 ACRP10323 421 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 SLC39A14Q15043 492 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 TMEM240Q5SV17 173 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 PTPRSQ13332 1948 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 CXCL10P02778 98 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 CTSHP09668 335 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 MUTP22033 750 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 RFC2P35250 354 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 DRP2Q13474 957 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 SHHQ15465 462 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 TCTN1Q2MV58 587 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 ZNF365Q70YC5 407 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 NME8Q8N427 588 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 ERMNQ8TAM6 284 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 RAB34Q9BZG1 259 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LINC00879-201ENST00000462219 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LINC00879-201ENST00000462219 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LINC00879-201ENST00000462219 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LINC00879-201ENST00000462219 RARRES1P49788 294 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms