RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409441.5

LIMS1-204, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-204ENST00000409441 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 BANK1Q8NDB2 785 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 DYDC2Q96IM9 177 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 MED24O75448 989 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 SMC2O95347 1197 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 ASGR1P07306 291 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 ZNF286BP0CG31 522 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 RPA1P27694 616 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 GJA8P48165 433 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 GSDMDP57764 484 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 PSMC5P62195 406 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 CABP7Q86V35 215 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 TRIM50Q86XT4 487 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 MLKLQ8NB16 471 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 SMARCE1Q969G3 411 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 H3BRB1 525 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 SLFN14P0C7P3 912 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 UGCGQ16739 394 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 SPATA20Q8TB22 786 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 NEK9Q8TD19 979 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 EMSYQ7Z589 1322 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 CBFA2T2O43439 604 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 ATP4AP20648 1035 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 ACLYP53396 1101 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 MORC3Q14149 939 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 ECM1Q16610 540 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 KAT2BQ92831 832 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 PLIN2Q99541 437 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 LXNQ9BS40 222 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 POTEB3A0JP26 581 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 KBTBD13C9JR72 458 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 DNM1LO00429 736 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 ZNF862O60290 1169 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 MARK3P27448 753 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 TXLNAP40222 546 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 SLC26A2P50443 739 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 CHMP4BP1P59074 171 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 POTEBQ6S5H4 581 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 C4orf19Q8IY42 314 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 CALML4Q96GE6 196 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 PNMA5Q96PV4 448 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 ZBTB39O15060 712 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 SLC26A4O43511 780 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 STBD1O95210 358 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 F2P00734 622 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 PRR29P0C7W0 189 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 MUTP22033 750 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 FANCCQ00597 558 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 GRB10Q13322 594 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 HYIQ5T013 277 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 ISM2Q6H9L7 571 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 POTEGQ6S5H5 508 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 NACC1Q96RE7 527 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.91□□□□□ -0.02
LIMS1-204ENST00000409441 IFNKQ9P0W0 207 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms