RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 FGGP02679 453 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 MARK3P27448 753 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 CDC27P30260 824 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 CLCN6P51797 869 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ADCY1Q08828 1119 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 NCAPGQ9BPX3 1015 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ABHD10Q9NUJ1 306 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 NMT2O60551 498 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 PRCPP42785 496 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 RNF139Q8WU17 664 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 TTC1Q99614 292 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 AP1M1Q9BXS5 423 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 F5H6K3 240 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 PODXLO00592 558 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 SLCO1A2P46721 670 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 KLRC3Q07444 240 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 SEL1LQ9UBV2 794 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 E9PMD0 336 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ORC4O43929 436 aa21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 CASP1P29466 404 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 TXNRD1Q16881 649 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 CENPUQ71F23 418 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 SCYL3Q8IZE3 742 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 SDCCAG3Q96C92 435 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ANO9A1A5B4 782 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ARL13BQ3SXY8 428 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 DCLK2Q8N568 766 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 EXOC4Q96A65 974 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V1E2Q96A05 226 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 HVCN1Q96D96 273 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 MID2Q9UJV3 735 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ABCB11O95342 1321 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINB6P35237 376 aa21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ECE2O60344 883 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 MAP2K2P36507 400 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 KCNH2Q12809 1159 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 HAUS8Q9BT25 410 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 RCN2Q14257 317 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 TBK1Q9UHD2 729 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 SFNP31947 248 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 SESN3P58005 492 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 TTC4O95801 387 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 COASYQ13057 564 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 OR6B3Q8NGW1 331 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 PYROXD1Q8WU10 500 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.78■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 USP31Q70CQ4 1352 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 TJP3O95049 919 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 NR1D1P20393 614 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ARID5BQ14865 1188 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 C6orf118Q5T5N4 469 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 NUDCD1Q96RS6 583 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 FAM196BA6NMK8 535 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 PSMA2P25787 234 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 FOXO4P98177 505 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 SLC7A5Q01650 507 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM68Q6AZZ1 485 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 EP400NLQ6ZTU2 488 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ABCB6Q9NP58 842 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 RNF146Q9NTX7 359 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ANAPC7Q9UJX3 599 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 POTEB3A0JP26 581 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 POTECB2RU33 542 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 KRT10P13645 584 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 GCLMP48507 274 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms