RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC34Q96HJ3 373 aa30.97■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 CEP170P1Q96L14 293 aa30.97■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PQY0 241 aa30.97■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 PLA2G4BP0C869 781 aa30.97■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 PLA2G4FQ68DD2 849 aa30.97■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 CYP26B1Q9NR63 512 aa30.97■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 SERTAD1Q9UHV2 236 aa30.97■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF35A5YM69 484 aa30.96■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 KINO60870 393 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
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GIPC1-201ENST00000345425 ZNF484Q5JVG2 852 aa30.96■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 SV2BQ7L1I2 683 aa30.96■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
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GIPC1-201ENST00000345425 COL1A2P08123 1366 aa30.96■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM150BA6NC51 233 aa30.95■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
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GIPC1-201ENST00000345425 NFKBIBQ15653 356 aa30.95■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 MTERF2Q49AM1 385 aa30.95■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 C7orf31Q8N865 590 aa30.95■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 CNNM3Q8NE01 707 aa30.95■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 TIGD1Q96MW7 591 aa30.95■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 STARD7Q9NQZ5 370 aa30.95■■■□□ 2.55
GIPC1-201ENST00000345425 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP30.94■■■□□ 2.54
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GIPC1-201ENST00000345425 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa30.94■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 INSRRP14616 1297 aa30.94■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 KRBA2Q6ZNG9 492 aa30.94■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 BRCA2P51587 3418 aa30.94■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 NRCAMQ92823 1304 aa30.94■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 ARID2Q68CP9 1835 aa30.94■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 SLC12A3P55017 1021 aa30.94■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 NPEPPSP55786 919 aa30.94■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
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GIPC1-201ENST00000345425 KANK3Q6NY19 840 aa30.94■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 GPT2Q8TD30 523 aa30.94■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC27Q9C0I9 530 aa30.94■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 TNMDQ9H2S6 317 aa30.94■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 KAT6AQ92794 2004 aa30.93■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 RRN3P2A6NIE6 340 aa30.93■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 AMPD3Q01432 767 aa30.93■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 NFRKBQ6P4R8 1299 aa30.93■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 EXOC8Q8IYI6 725 aa30.93■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 SH2D3AQ9BRG2 576 aa30.93■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 ITGA7Q13683 1181 aa30.92■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 GRIK4Q16099 956 aa30.92■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa30.92■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 KBTBD4Q9NVX7 518 aa30.92■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 KCND2Q9NZV8 630 aa30.92■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 GNAT1P11488 350 aa30.92■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 PADI6Q6TGC4 694 aa30.92■■■□□ 2.54
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GIPC1-201ENST00000345425 RFC5P40937 340 aa30.91■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa30.91■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 SESTD1Q86VW0 696 aa30.91■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 HDAC6Q9UBN7 1215 aa30.91■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
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GIPC1-201ENST00000345425 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 GPBP1Q86WP2 473 aa30.9■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 SLC7A3Q8WY07 619 aa30.9■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 CEP89Q96ST8 783 aa30.9■■■□□ 2.54
GIPC1-201ENST00000345425 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
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GIPC1-201ENST00000345425 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
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GIPC1-201ENST00000345425 HOXC8P31273 242 aa30.88■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 AFMP43652 599 aa30.88■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa30.88■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 MAFO75444 373 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 MYL1P05976 194 aa30.87■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 C1orf186Q6ZWK4 172 aa30.87■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 RETREG2Q8NC44 543 aa30.87■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa30.87■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 STAMQ92783 540 aa30.87■■■□□ 2.53
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