RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa27.54■■■□□ 2
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SENP3-201ENST00000321337 H2AFZP0C0S5 128 aa27.54■■■□□ 2
SENP3-201ENST00000321337 RSPH10BP0C881 870 aa27.54■■■□□ 2
SENP3-201ENST00000321337 DRD4P21917 467 aa27.54■■■□□ 2
SENP3-201ENST00000321337 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 27e-33■■■■■ 34.5
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SENP3-201ENST00000321337 HVCN1Q96D96 273 aa27.5■■□□□ 1.99
SENP3-201ENST00000321337 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa27.5■■□□□ 1.99
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SENP3-201ENST00000321337 SLC35G2Q8TBE7 412 aa27.5■■□□□ 1.99
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SENP3-201ENST00000321337 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SENP3-201ENST00000321337 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
SENP3-201ENST00000321337 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa27.49■■□□□ 1.99
SENP3-201ENST00000321337 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
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