RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293349.10

PLEKHH3-201, Transcript of pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene PLEKHH3, Length 2,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHH3-201ENST00000293349 MEIS2O14770 477 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 LRRN2O75325 713 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 PPP2R5AQ15172 486 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 METTL13Q8N6R0 699 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 GDF3Q9NR23 364 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 SMIM23A6NLE4 172 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 KRIT1O00522 736 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 DAPK3O43293 454 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 KIF4AO95239 1232 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 NR1D1P20393 614 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 ODF2Q5BJF6 829 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 RPAINQ86UA6 219 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 CCDC189A1A4V9 331 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 SART1O43290 800 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 ATP2C2O75185 946 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 NR2E1Q9Y466 385 aa22.11■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 ABCB11O95342 1321 aa22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 NR3C1P04150 777 aa22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 TMOD1P28289 359 aa22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 IQCKQ8N0W5 287 aa22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 MYH4Q9Y623 1939 aa22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 TNNC1P63316 161 aa22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 ALS2CLQ60I27 953 aa22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 CAVIN3Q969G5 261 aa22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 E7EVH7 732 aa22.09■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 TTI1O43156 1089 aa22.09■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 CFBP00751 764 aa22.09■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 SATB1Q01826 763 aa22.09■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 ITIH3Q06033 890 aa22.09■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 MYCT1Q8N699 235 aa22.09■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.09■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 ICA1Q05084 483 aa22.09■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.09■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 TSKSQ9UJT2 592 aa22.09■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.08■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 LSP1P33241 339 aa22.08■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 CRY2Q49AN0 593 aa22.08■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 AADACL2Q6P093 401 aa22.08■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.08■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 TEKT1Q969V4 418 aa22.08■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.08■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.08■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 BBOX1O75936 387 aa22.08■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 GNA14O95837 355 aa22.08■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 NOVP48745 357 aa22.08■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PLEKHH3-201ENST00000293349 F5H6K3 240 aa22.08■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 HSD17B3P37058 310 aa22.08■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 KLRC3Q07444 240 aa22.08■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 GOPCQ9HD26 462 aa22.08■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 NRAPQ86VF7 1730 aa22.07■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 MSH4O15457 936 aa22.07■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 JAG1P78504 1218 aa22.07■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 CHADLQ6NUI6 762 aa22.07■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 PALB2Q86YC2 1186 aa22.07■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.07■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 ASTN1O14525 1302 aa22.07■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.07■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 KIAA0754O94854 1291 aa22.07■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.07■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 VPS72Q15906 364 aa22.07■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 CCDC174Q6PII3 467 aa22.07■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.07■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.06■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 SLC35C1Q96A29 364 aa22.06■■□□□ 1.12
PLEKHH3-201ENST00000293349 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms