RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 MRC1P22897 1456 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 CCT8L1PA6NM43 557 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 ORC4O43929 436 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 SUN1O94901 812 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 UCHL3P15374 230 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 TAF11Q15544 211 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 KLHL14Q9P2G3 628 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 MAD2L2Q9UI95 211 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.58■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 CALUO43852 315 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 BTDP43251 543 aa16.58■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 KCNJ1P48048 391 aa16.58■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 ARMC9Q7Z3E5 817 aa16.58■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 TPH2Q8IWU9 490 aa16.58■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 NT5C3AQ9H0P0 336 aa16.58■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 ANAPC4Q9UJX5 808 aa16.58■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 EXOC3O60645 756 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ZNF131P52739 623 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 CDK17Q00537 523 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 CYP4F22Q6NT55 531 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 SFR1Q86XK3 245 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 BAP1Q92560 729 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 CUL5Q93034 780 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 TRIM7Q9C029 511 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 NEUROG2Q9H2A3 272 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ECT2Q9H8V3 914 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 MYH6P13533 1939 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 EVI5O60447 810 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 EEF2P13639 858 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 USP11P51784 963 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 GALCP54803 685 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 GSTO1P78417 241 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 KCNMA1Q12791 1236 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 LONRF1Q17RB8 773 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ACCSLQ4AC99 568 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 NSMFQ6X4W1 530 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 LZTS2Q9BRK4 669 aa16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 TRAPPC3O43617 180 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 CETN1Q12798 172 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 C4orf32Q8N8J7 132 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 IL17RBQ9NRM6 502 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 NAGPAQ9UK23 515 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 CDK8P49336 464 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 BIRC2Q13490 618 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 FBXO25Q8TCJ0 367 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 LRRC15Q8TF66 581 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 UPP2O95045 317 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ANP32DO95626 131 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PRPHP41219 470 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ITIH3Q06033 890 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 GNPTABQ3T906 1256 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 RUBCNQ92622 972 aa16.57■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ERVV-1B6SEH8 477 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 UBXN2AP68543 259 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ZBTB16Q05516 673 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 DDB1Q16531 1140 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 RCSD1Q6JBY9 416 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 BHMT2Q9H2M3 363 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 MYH2Q9UKX2 1941 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 THAP12O43422 761 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 TLR2O60603 784 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 SHBGP04278 402 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 TRIM49P0CI25 452 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 TRIM49CP0CI26 452 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 SIK1P57059 783 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PIGOQ8TEQ8 1089 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 MIEF2Q96C03 454 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PLCB3Q01970 1234 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 KRT15P19012 456 aa16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 TCP10Q12799 353 aa16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 DRP2Q13474 957 aa16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 FAM182BQ5T319 152 aa16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms