RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268673.11

PDPK1-201, Transcript of 3-phosphoinositide dependent protein kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPK1, Length 4,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPK1-201ENST00000268673 CYP4A11Q02928 519 aa15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 SNX1Q13596 522 aa15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 ABCB5Q2M3G0 1257 aa15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 MIER3Q7Z3K6 550 aa15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 CLIC2O15247 247 aa15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 RAD51CO43502 376 aa15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 CDK17Q00537 523 aa15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 SPARCL1Q14515 664 aa15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 RSAD2Q8WXG1 361 aa15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 C7orf25Q9BPX7 421 aa15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 TFR2Q9UP52 801 aa15.97■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 RWDD2BP57060 319 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 CAVIN3Q969G5 261 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 AS3MTQ9HBK9 375 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 POLR2MP0CAP2 368 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 MAPK4P31152 587 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 COASYQ13057 564 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 NR1H3Q13133 447 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 ODR4Q5SWX8 454 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 GLG1Q92896 1179 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 TRIM11Q96F44 468 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 CA4P22748 312 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 ANXA13P27216 316 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 BFSP1Q12934 665 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 HLFQ16534 295 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 FIGNQ5HY92 759 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 USP38Q8NB14 1042 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 FAM167BQ9BTA0 163 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 DONSONQ9NYP3 566 aa15.96■□□□□ 0.15
PDPK1-201ENST00000268673 K7ENM7 598 aa15.96■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 TMOD1P28289 359 aa15.96■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 NSFP46459 744 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 ATP2A3Q93084 1043 aa15.96■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 CCND1P24385 295 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 HERVK_113P62684 666 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 AOC3Q16853 763 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 GNPTABQ3T906 1256 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 LRRC37BQ96QE4 947 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 LACRTQ9GZZ8 138 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 BARHL2Q9NY43 387 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 RASSF10A6NK89 507 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 USP17L8P0C7I0 530 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 CHN1P15882 459 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 PDIA6Q15084 440 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 NAB2Q15742 525 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 USP17L2Q6R6M4 530 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 TRIM42Q8IWZ5 723 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 KCNG1Q9UIX4 513 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 DIAPH2O60879 1101 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 BRAFP15056 766 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 SLC8A3P57103 927 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 CAV1Q03135 178 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 STK4Q13043 487 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 DBNDD1Q9H9R9 158 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 C1orf112Q9NSG2 853 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 SERPINB13Q9UIV8 391 aa15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 OR2W6PQ8NHA6 318 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 COA7Q96BR5 231 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 PAGR1Q9BTK6 254 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 BPIFB4P59827 614 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 SEPT14Q6ZU15 432 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 RFFLQ8WZ73 363 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 PLA2G12BQ9BX93 195 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 AMNQ9BXJ7 453 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 TMEM60Q9H2L4 133 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 CLRN2A0PK11 232 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 USP17L3A6NCW0 530 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 USP17L4A6NCW7 530 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 POTEMA6NI47 508 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 H0Y3Z8 333 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 ORC4O43929 436 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 FAM47EQ6ZV65 393 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 NT5C1BQ96P26 610 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 CSRNP1Q96S65 589 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 USH1CQ9Y6N9 552 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 NBPF26B4DH59 902 aa15.94■□□□□ 0.14
PDPK1-201ENST00000268673 PFDN1O60925 122 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms