RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000128399.1

Ptprr-204, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprr, Length 2,173 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Uso1	Q9Z1Z0	959 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Myh7b	A2AQP0	1941 aa		13.33	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Ctcfl	A2APF3	636 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Bmp2	P21274	394 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Gm5169	Q5M8P2	212 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Krt14	Q61781	484 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Sema4a	Q62178	760 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Dzip3	Q7TPV2	1204 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Fam181b	Q80VF6	417 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Ift74	Q8BKE9	600 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Tspyl4	Q8VD63	406 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Sec16b	Q91XT4	1051 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Nmd3	Q99L48	503 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Drc3	Q9D5E4	523 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Rab11fip1	Q9D620	645 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Apbb2	Q9DBR4	760 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Vnn1	Q9Z0K8	512 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Map3k19	E9Q3S4	1311 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	C5	P06684	1680 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Gm21680	A0A0G2JGR8	267 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Cdc27	A2A6Q5	825 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Frmd7	A2AD83	703 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Rpl5	P47962	297 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Kansl1l	Q5DTI6	991 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Bnip1	Q6QD59	228 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Ccdc154	Q6RUT8	657 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Fam107a	Q78TU8	144 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Ripor2	Q80U16	1078 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Hhat	Q8BMT9	499 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Mtrr	Q8C1A3	696 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Stap2	Q8R0L1	411 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Stk38	Q91VJ4	465 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Mov10l1	Q99MV5	1187 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Trim12a	Q99PQ1	284 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Ska1	Q9CPV1	254 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Ccdc43	Q9CR29	222 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Pycard	Q9EPB4	193 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Flii	Q9JJ28	1271 aa		13.32	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Myh2	G3UW82	1942 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Mms22l	B1AUR6	1238 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Kif28p	D3YXS5	1028 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Slc7a1	Q09143	622 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Yy2	Q3TTC2	378 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Rufy4	Q3TYX8	563 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Gm4951	Q3UED7	406 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Trim28	Q62318	834 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Secisbp2l	Q6A098	1086 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Gpr150	Q8BL07	427 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Sec62	Q8BU14	398 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Prl7b1	Q8CGZ9	251 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Tmem39a	Q9CYC3	486 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Misp	Q9D279	648 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Rbm8a2	A0A0N4SUH6	174 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Phf11	A6H5X4	337 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Morc3	F7BJB9	942 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Copb2	O55029	905 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Magoh	P61327	146 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Pafah1b1	P63005	410 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Cct7	P80313	544 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Sptlc2	P97363	560 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Trip13	Q3UA06	432 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Eml4	Q3UMY5	988 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Arhgef38	Q80VK6	770 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Prpf18	Q8BM39	342 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Dzip1	Q8BMD2	852 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Trim68	Q8K243	485 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Mnd1	Q8K396	205 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Itpka	Q8R071	459 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Zbtb44	Q8R0A2	453 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Ascc2	Q91WR3	749 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Magohb	Q9CQL1	146 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Rbm8a	Q9CWZ3	174 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Nphs1	Q9QZS7	1256 aa		13.31	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	CN725425	A0A087WRU1	652 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Zfp839	E9PUU5	921 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Kif23	E9Q5G3	953 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Gm1758	F6VZZ1	202 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Zfp212	G3X8R7	492 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Bcl7c	O08664	217 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Unc5c	O08747	931 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Gja8	P28236	440 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Crhr1	P35347	415 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Helq	Q2VPA6	1069 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Trim43a	Q3TL54	445 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Vmn1r209	Q5NC97	312 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Vav2	Q60992	868 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Idi2	Q8BFZ6	227 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Rmdn2	Q8BSE0	410 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Parp10	Q8CIE4	960 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Spata2	Q8K004	515 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Taco1	Q8K0Z7	294 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Tsnaxip1	Q99P25	704 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Ttc14	Q9CSP9	761 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Speer4b	Q9D9F7	267 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Selenoo	Q9DBC0	667 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Sh2b2	Q9JID9	621 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Ak2	Q9WTP6	239 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Noc2l	Q9WV70	747 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Mzf1	S4R1L6	814 aa		13.3	□□□□□ -0.28
Ptprr-204	ENSMUST00000128399	Als2	Q920R0	1651 aa		13.3	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.1 ms