RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000079702.3

Cbx1-202, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kmt5aQ2YDW7 349 aa13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 P4ha1Q60715 534 aa13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dll1Q61483 722 aa13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Crtc1Q68ED7 630 aa13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Hook2Q7TMK6 716 aa13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Prb1Q91X93 504 aa13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Clstn3Q99JH7 956 aa13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccdc96Q9CR92 584 aa13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tbc1d15Q9CXF4 671 aa13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Calml3Q9D6P8 149 aa13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem206Q9D771 350 aa13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cnpy2Q9QXT0 182 aa13.5□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm3164L7N2B9 238 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm3264L7N2C5 238 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Per1O35973 1291 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 P04214 136 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 MafP54843 370 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Casp7P97864 303 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Echdc2Q3TLP5 296 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vwa3aQ3UVV9 1148 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Islr2Q5RKR3 745 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ntan1Q64311 310 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Drc7Q6V3W6 876 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Celf4Q7TSY6 486 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Smad3Q8BUN5 425 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Usp38Q8BW70 1042 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 EtnpplQ8BWU8 499 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sept8Q8CHH9 429 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mrgprx1Q8CIP3 322 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Q922R1 422 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Clp1Q99LI9 425 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Polr3eQ9CZT4 710 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mageb3Q9D2H4 330 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Snrnp35Q9D384 244 aa13.49□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm6133B2RY53 190 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm8909G3UXE9 396 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm21969J3QJZ1 289 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Casq1O09165 405 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rnaseh1O70338 285 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Axin2O88566 840 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gpr25P0C5I1 358 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rsph3aQ3UFY4 516 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Snx27Q3UHD6 539 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mier3Q3UHF3 551 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm28047Q3US59 414 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ubash3aQ3V3E1 624 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ssh1Q76I79 1042 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Amer1Q7TS75 1132 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Asnsd1Q8BFS9 627 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mettl24Q8CCB5 363 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vopp1Q8R1C3 172 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CutaQ9CQ89 177 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rsph3bQ9DA80 389 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Acox2Q9QXD1 681 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tnfsf13bQ9WU72 309 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Akt3Q9WUA6 479 aa13.48□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Igkv10-96A0A140T8M1 115 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Akap17bA2A3V1 959 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm5134E9QAB5 671 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vmn2r55G3UWZ4 781 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vmn2r53L7N473 806 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Terf2O35144 541 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Serpina1aP07758 413 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Serpina1bP22599 413 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 IppP28575 584 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Wdr5P61965 334 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Serpina1cQ00896 412 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Serpina1dQ00897 413 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fam198aQ3UY90 562 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cpa2Q504N0 417 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccna1Q61456 421 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccdc66Q6NS45 935 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mtss1lQ6P9S0 715 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Acot5Q6Q2Z6 421 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Celf6Q7TN33 460 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PodnQ7TQ62 611 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc15a5Q8CBB2 566 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Wdr11Q8K1X1 1223 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tspan8Q8R3G9 235 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Eml3Q8VC03 897 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Spdl1Q923A2 608 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Wfdc1Q9ESH5 211 aa13.47□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 GclmO09172 274 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccl5P30882 91 aa13.46□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Psmc2P46471 433 aa13.46□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mark2Q05512 776 aa13.46□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Drp2Q05AA6 957 aa13.46□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Bpifa6Q0VGU8 367 aa13.46□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa13.46□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pnma5Q5DTT8 618 aa13.46□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trpc6Q61143 930 aa13.46□□□□□ -0.25
Cbx1-202ENSMUST00000079702 LbpQ61805 481 aa13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.7 ms