RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm2237E9Q501 211 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm3591K7N6X2 186 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SpertQ32MG2 446 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Foxred2Q3USW5 665 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nkiras1Q8CEC5 192 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trim7Q923T7 510 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cnot8Q9D8X5 292 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stat2Q9WVL2 923 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trip6Q9Z1Y4 480 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krt10P02535 570 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccna1Q61456 421 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cnot10Q8BH15 744 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ppp1r14cQ8R4S0 164 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Yipf1Q91VU1 306 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SyncQ9EPM5 470 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Usp21Q9QZL6 566 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rnf17Q99MV7 1640 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atp7bQ64446 1462 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rabgap1A2AWA9 1064 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Il2P04351 169 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mgat1P27808 447 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zc3h18Q0P678 948 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nsun7Q14AW5 724 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ttf2Q5NC05 1138 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pabpc4Q6PHQ9 660 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NfrkbQ6PIJ4 1296 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atg16l1Q8C0J2 607 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc65Q8VHI7 493 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ggps1Q9WTN0 300 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Acad12D3Z7X0 555 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fam81aQ3UXZ6 364 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NntQ61941 1086 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Best2Q8BGM5 508 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Casp14O89094 257 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Eno3P21550 434 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Upf3bQ3ULL6 472 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Morc4Q8BMD7 928 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 C87977A2A958 498 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Lrrc63A6H694 637 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mark3Q03141 753 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cage1Q5IR70 849 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mxd3Q80US8 206 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 E330017A01RikQ8BU47 192 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rfx6Q8C7R7 927 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Alas1Q8VC19 642 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trim42Q9D2H5 723 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 EsrraO08580 422 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mum1l1Q4VA55 681 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc154Q6RUT8 657 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ptrh1Q8BW00 204 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mrps22Q9CXW2 359 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ifi35Q9D8C4 286 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Abcg8Q9DBM0 673 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cul7Q8VE73 1689 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Plekhg4A0A1L1SU27 1217 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 OatP29758 439 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Anks1aP59672 1150 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Satb1Q60611 764 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Llgl1Q80Y17 1036 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ola1Q9CZ30 396 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kcnh2O35219 1162 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 TbckQ8BM85 762 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atxn7Q8R4I1 867 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pold3Q9EQ28 462 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slc13a1Q9JHI4 594 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm43302L7N1X8 611 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ercc4Q9QZD4 917 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ms4a2P20490 235 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fbxo44Q8BK26 255 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Palm2Q8BR92 376 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pnpt1Q8K1R3 783 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 PalmdQ9JHU2 551 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 D1Pas1P16381 660 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ptk2P34152 1090 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Impg2Q80XH2 1243 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hdac11Q91WA3 347 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ttc1Q91Z38 292 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Arl6ip4Q9JM93 229 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Abca6Q8K441 1624 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hecw1Q8K4P8 1604 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Myo1aO88329 1043 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Acot5Q6Q2Z6 421 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tlr2Q9QUN7 784 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sec23ipQ6NZC7 998 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cdk5rap3Q99LM2 503 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tlr3Q99MB1 905 aa16.4■□□□□ 0.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slc3a2P10852 526 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slc12a1P55014 1095 aa16.39■□□□□ 0.21
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26 ms