RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NynrinQ5DTZ0 1840 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Idh1O88844 414 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ranbp1P34022 203 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ap1m1P35585 423 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 D630036H23RikQ3UQD6 204 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sin3bQ62141 1098 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q6PD19 689 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fbxo10Q7TQF2 950 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 R3hdm2Q80TM6 1044 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ArP19091 899 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sfi1Q3UZY0 1216 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mcf2lQ64096 1149 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Churc1Q6DG52 112 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyp26b1Q811W2 512 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spats2Q8K1N4 545 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam71aB7XG49 585 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myo1cQ9WTI7 1063 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cd68P31996 326 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fgfr4Q03142 799 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gxylt1Q3UHH8 404 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zrsr2Q62377 462 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pde1cQ64338 706 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Naa15Q80UM3 865 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc14a1Q8VHL0 384 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Chn1Q91V57 459 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc83Q9D4V3 305 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Calr3Q9D9Q6 380 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cabp5Q9JLK3 173 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tlr2Q9QUN7 784 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DgkiD3YWQ0 1071 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc24E9PUW8 296 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp2r5cQ60996 524 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Haus1Q8BHX1 278 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fbxo28Q8BIG4 368 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pak2Q8CIN4 524 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem79Q9D709 391 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Extl2Q9ES89 330 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm4907B1AXB9 411 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Clrn2B2RVW2 232 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CatspereP0DP43 985 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt15Q61414 452 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 FdxrQ61578 494 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PicalmQ7M6Y3 660 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nemp2Q8CB65 421 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ddx47Q9CWX9 455 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rexo2Q9D8S4 237 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ankrd2Q9WV06 328 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eif3dO70194 548 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 H2afzP0C0S6 128 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 H2afvQ3THW5 128 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cd37Q61470 281 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gprc5cQ8K3J9 440 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Col23a1Q8K4G2 532 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lgi2Q8K4Z0 550 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mageb16Q9CWV4 363 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 E9QMW4 1145 aa28.57■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf367Q0VDT2 340 aa28.57■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MaeaQ4VC33 396 aa28.57■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vgll2Q8BGW8 322 aa28.57■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fthl17aQ9DAX0 182 aa28.57■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smchd1Q6P5D8 2007 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 LdhbP16125 334 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttc22Q8C159 568 aa28.57■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SyncQ9EPM5 470 aa28.57■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm45261A0A1B0GSP6 197 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 C87977A2A958 498 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DtnbO70585 659 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tph1P17532 447 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nr1d1Q3UV55 615 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam177a1Q8BR63 207 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dppa3Q8QZY3 150 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Capn9Q9D805 690 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pacsin2Q9WVE8 486 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tnnc1P19123 161 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ProcP33587 460 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sema3eP70275 775 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Acot6Q32Q92 419 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 BC051142Q3V0M8 400 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 TbataQ7TSD4 393 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vps52Q8C754 723 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc87Q8CDL9 855 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ergic2Q9CR89 377 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cse1lQ9ERK4 971 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Got1P05201 413 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gdpd4Q3TT99 632 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trip13Q3UA06 432 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prom2Q3UUY6 835 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Alg1Q921Q3 482 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Drap1Q9D6N5 205 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dydc1Q9D9T0 175 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppfia4B8QI36 1187 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Etv6P97360 485 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spout1Q3UHX9 385 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.8 ms