RNA–Protein interactions for RNA: snR46

snR46, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR46, Length 197 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR46	snR46	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
snR46	snR46	YML131W	Q03102	365 aa		0.29	□□□□□ -2.36
snR46	snR46	MSC3	Q05812	728 aa		0.29	□□□□□ -2.36
snR46	snR46	SOR2	Q07786	357 aa		0.29	□□□□□ -2.36
snR46	snR46	ATG29	Q12092	213 aa		0.29	□□□□□ -2.36
snR46	snR46	HSP42	Q12329	375 aa		0.29	□□□□□ -2.36
snR46	snR46	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		0.29	□□□□□ -2.36
snR46	snR46	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
snR46	snR46	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
snR46	snR46	MET28	P40573	187 aa		0.28	□□□□□ -2.36
snR46	snR46	RNH201	P53942	307 aa		0.28	□□□□□ -2.36
snR46	snR46	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
snR46	snR46	YDL211C	Q12121	372 aa		0.28	□□□□□ -2.36
snR46	snR46	STE2	D6VTK4	431 aa		0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	MET8	P15807	274 aa		0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	MSP1	P28737	362 aa		0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	BEM1	P29366	551 aa		0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	FUN26	P31381	517 aa		0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	ECM14	P38836	430 aa		0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	YEL057C	P39983	233 aa		0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	PHO86	P46956	311 aa		0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	MRX11	Q03079	207 aa		0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	YMR010W	Q03687	405 aa		0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	SIL1	Q08199	421 aa		0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	ATG34	Q12292	412 aa		0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	ENT1	Q12518	454 aa		0.27	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	MMS4	P38257	691 aa		0.26	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	UFE1	P41834	346 aa		0.26	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	COS1	P53822	381 aa		0.26	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	RMI1	Q02685	241 aa		0.26	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	STD1	Q02794	444 aa		0.26	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	MDM30	Q05930	598 aa		0.26	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	YOR376W	Q08900	122 aa		0.26	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	MCT1	Q12283	360 aa		0.26	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	YPR117W	Q06116	2489 aa		0.25	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	POM152	P39685	1337 aa		0.25	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	KRE2	P27809	442 aa		0.25	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	MED6	P38782	295 aa		0.25	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	BDH1	P39714	382 aa		0.25	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	FMS1	P50264	508 aa		0.25	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	SPR6	Q01684	191 aa		0.25	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	YPL113C	Q02961	396 aa		0.25	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	ATG16	Q03818	150 aa		0.25	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	BUG1	Q12191	341 aa		0.25	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	CUP2	P15315	225 aa		0.24	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	CPT1	P17898	393 aa		0.24	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	IES5	P40060	125 aa		0.24	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	SHE4	P51534	789 aa		0.24	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	VPS75	P53853	264 aa		0.24	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	YPL080C	Q02826	108 aa		0.24	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	MMT1	Q03218	510 aa		0.24	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	OPY2	Q06810	360 aa		0.24	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	YOL029C	Q08187	201 aa		0.24	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	PCL9	Q12477	304 aa		0.24	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	SCEI	P03882	235 aa		0.23	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	MET2	P08465	486 aa		0.23	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	COS9	P36034	407 aa		0.23	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	RRN10	P38204	145 aa		0.23	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	VAC7	P53950	1165 aa		0.23	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	URH1	Q04179	340 aa		0.23	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	FSH2	Q05015	223 aa		0.23	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	VPS54	Q12071	889 aa		0.23	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	SFM1	Q12314	213 aa		0.23	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	GCN4	P03069	281 aa		0.22	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	IMA3	P0CW40	589 aa		0.22	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	IMA4	P0CW41	589 aa		0.22	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	OCA4	P25366	362 aa		0.22	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	LDS1	P31379	325 aa		0.22	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	SPO23	P33757	523 aa		0.22	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	YMR262W	P38430	313 aa		0.22	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	RBG1	P39729	369 aa		0.22	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	ASG7	P46993	209 aa		0.22	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	YDR131C	Q03899	556 aa		0.22	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	IMA2	Q08295	589 aa		0.22	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	VAM3	Q12241	283 aa		0.22	□□□□□ -2.37
snR46	snR46	TOR1	P35169	2470 aa		0.21	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	SEM1	O94742	89 aa		0.21	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	COX10	P21592	462 aa		0.21	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	BRF1	P29056	596 aa		0.21	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	GPI10	P30777	616 aa		0.21	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	GEP4	P38812	185 aa		0.21	□□□□□ -2.38
snR46	snR46	HEM14	P40012	539 aa		0.21	□□□□□ -2.38

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.2 ms