RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	AIM22	P47051	409 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	ECL1	P48235	211 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	MSY1	P48527	492 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	GMC2	Q06201	188 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	MRL1	Q06815	381 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	PUN1	Q06991	263 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YHR177W	P38867	453 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SHO1	P40073	367 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	RIC1	P40395	1056 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	AVT7	P40501	490 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.97	□□□□□ -1.77	not detected
YNL057W	YNL057W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	GTR2	P53290	341 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	ASI1	P54074	624 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YPL071C	Q02864	156 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	INP1	Q03694	420 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	USA1	Q03714	838 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YDR249C	Q03787	373 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	RAF1	Q06891	181 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	COS7	Q07788	383 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	ATG34	Q12292	412 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SWM1	Q12379	170 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	PDX1	P16451	410 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YCK1	P23291	538 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	MRPL25	P23369	157 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	OCA4	P25366	362 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YME1	P32795	747 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	MRPL16	P38064	232 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YJL193W	P39542	402 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	ECM10	P39987	644 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	MRPS18	P42847	217 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	TAF6	P53040	516 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	RNH70	P53331	553 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	NCE101	Q02820	53 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	API2	Q04413	109 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	BUR2	Q05949	395 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SPO24	Q3E752	67 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	MDH2	P22133	377 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	DBF20	P32328	564 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YKR073C	P36153	106 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	ANS1	P38832	159 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YEN1	P40028	759 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	GDS1	P41913	522 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YFR054C	P43622	192 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	BIT61	P47041	543 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	DUG3	P53871	357 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SHR3	Q02774	210 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	RNH1	Q04740	348 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	TRP3	P00937	484 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	ATP4	P05626	244 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	CBS1	P14066	229 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	TFS1	P14306	219 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SAN1	P22470	610 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YPT7	P32939	208 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SPC29	P33419	253 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	BYE1	P36106	594 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	EXO84	P38261	753 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	NSG1	P38837	291 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	MTC6	P38849	526 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	IDP2	P41939	412 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	LEM3	P42838	414 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	IRC15	Q02733	499 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SWP1	Q02795	286 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SNX41	Q04053	625 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YPQ2	Q06328	317 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	MSA1	Q08471	629 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YLR053C	Q12026	108 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YPR096C	O13587	100 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	RHO2	P06781	192 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	NUP1	P20676	1076 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	DBF2	P22204	572 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SEC17	P32602	292 aa		3.93	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.4 ms