RNA–Protein interactions for RNA: YML031W

NDC1, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NDC1, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NDC1	YML031W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	MNN2	P38069	597 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	IES5	P40060	125 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YRB2	P40517	327 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	COS4	P43542	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	IRC5	P43610	853 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YJR154W	P47181	346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	RMR1	P53060	241 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	DSL1	P53847	754 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	MSC1	Q03104	513 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	GMC2	Q06201	188 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	GGA1	Q06336	557 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ULA1	Q12059	462 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	BAG7	Q12128	409 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	TPK2	P06245	380 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	CTR86	P25355	563 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	CSM1	P25651	190 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ATP7	P30902	174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	BET3	P36149	193 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	SYG1	P40528	902 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	MSS2	P40990	351 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ECO1	P43605	281 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	AIM22	P47051	409 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	SLM2	P53955	656 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YNL033W	P53964	284 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YNL019C	P53975	284 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	MMT1	Q03218	510 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	PSR1	Q07800	427 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	NSL1	Q12143	216 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YRM1	Q12340	786 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	DST1	P07273	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	PET122	P10355	254 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	KSS1	P14681	368 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	GCN3	P14741	305 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	DAP2	P18962	818 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	OCA4	P25366	362 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ARE1	P25628	610 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	PTR2	P32901	601 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	MSN2	P33748	704 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	SPO23	P33757	523 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	RCN1	P36054	211 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	GIP2	P40036	548 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	MEP2	P41948	499 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YJL055W	P47044	245 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	APS3	P47064	194 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	CIK1	Q01649	594 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	MGR3	Q04472	501 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	REP1	P03871	373 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	RAP1	P11938	827 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	CBS2	P14905	389 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	UGA1	P17649	471 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	FAR1	P21268	830 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	GPI12	P23797	304 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ERG8	P24521	451 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	VPS51	P36116	164 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	SKG1	P36169	355 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YPK3	P38070	525 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YBL029W	P38201	376 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	IST2	P38250	946 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
NDC1	YML031W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	TRR2	P38816	342 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	ATG7	P38862	630 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	PKP1	P40530	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	TED1	P40533	473 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	CIN1	P40987	1014 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	IMA1	P53051	589 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	YOS9	Q99220	542 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	PBS2	P08018	668 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NDC1	YML031W	CCA1	P21269	546 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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