RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W PTC6P25646 442 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W BUD14P27637 709 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YIM1P28625 365 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SSH4P32343 579 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W LTV1P34078 463 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YBP1P38315 674 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SEO1P39709 593 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W BOP3P53958 396 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W EFM6P53970 246 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W NGL3Q03210 505 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TLG1Q03322 224 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W GRX3Q03835 250 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YDR109CQ04585 715 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YOL159CQ08300 171 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SLD7Q08457 257 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SWT1Q12104 458 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YDL211CQ12121 372 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data2.01□□□□□ -2.09not detected
SSQ1YLR369W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YLR302CO13544 120 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YML003WP0CF16 290 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YAR066WP0CX18 203 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YHR214WP0CX19 203 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SPO16P17122 198 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W GLK1P17709 500 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W STP22P25604 385 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TIP20P33891 701 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SKT5P34226 696 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W HES1P35843 434 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W JNM1P36224 373 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W FLO5P38894 1075 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MET30P39014 640 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W UTP18P40362 594 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RIC1P40395 1056 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W BIO3P50277 480 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ATG23Q06671 453 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ETT1Q08421 412 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MMT2Q08970 484 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ATG9Q12142 997 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YLL056CQ12177 298 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W PST1Q12355 444 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RRI1Q12468 440 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W Q0297Q9ZZV8 51 aa2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YCR099CP25657 155 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ADE1P27616 306 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W UBC6P33296 250 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YPT52P36018 234 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RRN3P36070 627 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YSW1P38280 609 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W FAD1P38913 306 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W DJP1P40564 432 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W HYR1P40581 163 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W HOC1P47124 396 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MPS2P53159 387 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ROY1Q04847 553 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SNO4Q04902 237 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YLR281CQ05863 155 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W HSP33Q08914 237 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W HSP32Q08992 237 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W LDB17Q12342 491 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W BPH1P25356 2167 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SUI3P09064 285 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W HSC82P15108 705 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W DBF4P32325 704 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MAL32P38158 584 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W PCL6P40038 420 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ICE2P40499 491 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W AZF1P41696 914 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ECO1P43605 281 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SEH1P53011 349 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W OAZ1Q02803 292 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W CAC2Q04199 468 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SOV1Q04748 898 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SNA4Q07549 140 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YDR018CQ12185 396 aa1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TEF1P02994 458 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YFL068WP0CX99 160 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YLL066W-AP0CY00 160 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YLL067W-AP0CY01 160 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RER1P25560 188 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MGR1P25573 417 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TAH1P25638 111 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W NDI1P32340 513 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MCM10P32354 571 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W KKQ8P36004 724 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W BYE1P36106 594 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MRP21P38175 177 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RRN10P38204 145 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ARC40P38328 384 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YGP1P38616 354 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W HIS2P38635 335 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W INM1P38710 295 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W BZZ1P38822 633 aa1.98□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W VPS41P38959 992 aa1.98□□□□□ -2.09
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