RNA–Protein interactions for RNA: YLR119W

SRN2, Transcript of Component of the ESCRT-I complex, yeast

Gene SRN2, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRN2	YLR119W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	DOA1	P36037	715 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	CLD1	P53264	445 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	YKL097C	P34245	136 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	HAL1	Q01766	294 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	AAD15	Q08361	143 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	RNH203	Q12338	110 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	TPK3	P05986	398 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	MNE1	P24720	663 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	YHK8	P38776	514 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	YHR131C	P38835	850 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	MIG3	P39943	394 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	URC2	Q04411	772 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	YOP1	Q12402	180 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	SRN2	Q99176	213 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	YSC83	P32792	385 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	MDL1	P33310	695 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	RTT102	P53330	157 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	TDA1	Q03533	586 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	AHC1	Q12433	566 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	SPT10	P35208	640 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	EFM4	P40516	257 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	COS1	P53822	381 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	PCL1	P24867	279 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	OXA1	P39952	402 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	OPI3	P05375	206 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
SRN2	YLR119W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	JEM1	P40358	645 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	EGT2	P42835	1041 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	ATG18	P43601	500 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	CRH1	P53301	507 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	MEH1	Q02205	184 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	TSA2	Q04120	196 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	LIP2	Q06005	328 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	ECM7	Q06200	448 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	BNS1	P50084	137 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	PMT5	P52867	743 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	ERO1	Q03103	563 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	ASA1	Q06822	443 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	PCL9	Q12477	304 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	PUP2	P32379	260 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	UTH1	P36135	365 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	PFF1	P38244	976 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	MNL1	P38888	796 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	MLH1	P38920	769 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	MLC1	P53141	149 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	YET2	Q04210	160 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	IPK1	Q06667	281 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	LDS2	Q08218	356 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	GPX2	P38143	162 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	GEP4	P38812	185 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	RRN9	P53437	365 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	FCY22	Q12119	530 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	CDC50	P25656	391 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	FUN26	P31381	517 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	OM14	P38325	134 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	YER186C	P40101	306 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	TOS2	P50078	622 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SRN2	YLR119W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	TIR2	P33890	251 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	MRP21	P38175	177 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	ECM8	P38246	354 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	EPL1	P43572	832 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	RCF1	Q03713	159 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	HMS1	Q12398	434 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	TOA2	P32774	122 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	YBL028C	P38202	106 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	WSS1	P38838	269 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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