RNA–Protein interactions for RNA: YGR279C

SCW4, Transcript of Cell wall protein with similarity to glucanases, yeast

Gene SCW4, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW4	YGR279C	GLE1	Q12315	538 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	PSY3	Q12318	242 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	COX1	P00401	534 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	CDC4	P07834	779 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YAK1	P14680	807 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YCR006C	P25350	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	CWH43	P25618	953 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	HIR2	P32480	875 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SPC34	P36131	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	BIG1	P38813	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	AIM2	P39721	246 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	GIP2	P40036	548 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SPG5	P42933	373 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	ELP2	P42935	788 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	MDV1	P47025	714 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YJR142W	P47173	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	LCL3	P53153	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YGR016W	P53209	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	COG5	P53951	403 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SPR6	Q01684	191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	RSC9	Q03124	581 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	ATP25	Q03153	612 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	RAD30	Q04049	632 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	BSC1	Q12140	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	MRX4	Q12467	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	TSC13	Q99190	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	RIP1	P08067	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SNF4	P12904	322 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	TEC1	P18412	486 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	MKK1	P32490	508 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	RPS27B	P38711	82 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	OCA5	P38738	679 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YLF2	P38746	405 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	PEX18	P38855	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	MPM1	P40364	252 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YIL152W	P40455	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	PMT4	P46971	762 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SPT20	P50875	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	RMR1	P53060	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YSA1	Q01976	231 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SPO19	Q03029	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	KRE28	Q04431	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YOL024W	Q08172	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	TFS1	P14306	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SEC62	P21825	274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	QDR2	P40474	542 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	MDE1	P47095	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	NUP57	P48837	541 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	TRM9	P49957	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YGR079W	P53249	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YGR168C	P53293	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YLR460C	P54007	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SWP1	Q02795	286 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	AI1	P03875	834 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	VPH2	P32341	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YKR073C	P36153	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	ECM1	P39715	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YEL020C	P39994	560 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	SPO73	P40031	143 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	MET28	P40573	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	CHA4	P43634	648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	EXG2	P52911	562 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	MSC1	Q03104	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCW4	YGR279C	YOR342C	Q12182	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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