RNA–Protein interactions for RNA: YCL014W

BUD3, Transcript of Protein involved in bud-site selection, yeast

Gene BUD3, Length 4,911 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD3	YCL014W	PNP1	Q05788	311 aa		1	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	YDL086W	Q07505	273 aa		1	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	LDB18	Q07887	179 aa		1	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	RSA1	Q08932	381 aa		1	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	SVS1	Q12254	260 aa		1	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	PCL9	Q12477	304 aa		1	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	MRP13	P12686	339 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	CMP2	P14747	604 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	MSH2	P25847	964 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	KIP1	P28742	1111 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	KRE6	P32486	720 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	XRS2	P33301	854 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	HOT13	P36078	116 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	YKL069W	P36088	180 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	MEP2	P41948	499 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	YFL015C	P43578	164 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	FAR3	P46671	204 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	YJR124C	P47159	448 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	MTQ1	P53944	314 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	ACS1	Q01574	713 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	URC2	Q04411	772 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	SIA1	Q12212	622 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	RRD2	Q12461	358 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	URA3	P03962	267 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	MNE1	P24720	663 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	PCL1	P24867	279 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	RPD3	P32561	433 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	PEP7	P32609	515 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	RCN1	P36054	211 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	FAT1	P38225	669 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	RFC3	P38629	340 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	CTM1	P38818	585 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	SAW1	P39735	261 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	0.99	□□□□□ -2.25	not detected
BUD3	YCL014W	OSW5	P40219	148 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	YIL152W	P40455	235 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	RPA43	P46669	326 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	TCB2	P48231	1178 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	YGR237C	P50089	785 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	STB4	P50104	949 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	NPY1	P53164	384 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	ASI1	P54074	624 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	VPS72	Q03388	795 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	YMR166C	Q03829	368 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	MRPL35	Q06678	367 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	DCI1	Q08558	271 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	YLR111W	Q12528	110 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	YML133C	Q03099	1374 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	YLL067C	Q07888	1374 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	YLL066C	Q99208	1374 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	PDR11	P40550	1411 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	TOP1	P04786	769 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	AAC3	P18238	307 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	PHO13	P19881	312 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	IFM1	P25038	676 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	RPC53	P25441	422 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	VBA3	P25594	458 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	ITR2	P30606	609 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	ERG3	P32353	365 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	YKL097C	P34245	136 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	MRPL17	P36528	281 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	BIT2	P38346	545 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	GPI16	P38875	610 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	PEX22	P39718	180 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	XBP1	P40489	647 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	AGX1	P43567	385 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	GLG2	P47011	380 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	TOM22	P49334	152 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	UBC11	P52492	156 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	TPC1	P53257	314 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	MGR3	Q04472	501 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	APC4	Q04601	652 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	DAL4	Q04895	635 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	REX3	Q12090	404 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	MED4	Q12343	284 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	YPT6	Q99260	215 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	MED11	Q99278	115 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	DBF4	P32325	704 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	MRP20	P32387	263 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	SRB5	P32585	307 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	MTC7	P32633	139 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BUD3	YCL014W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms