RNA–Protein interactions for RNA: YBR194W

AIM4, Transcript of Protein proposed to be associated with the nuclear pore complex, yeast

Gene AIM4, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM4	YBR194W	PPQ1	P32945	549 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	KKQ8	P36004	724 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YMR134W	P40207	237 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SEC9	P40357	651 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	RRT5	P43607	289 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SFH5	P47008	294 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	LOH1	P47055	219 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YGR117C	P53270	476 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	IBD2	P53892	351 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	ABZ2	Q03266	374 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YLH47	Q06493	454 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YOL075C	Q08234	1294 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YPL199C	Q08954	240 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	GLE1	Q12315	538 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YDR262W	Q12331	272 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	FSH3	Q99369	266 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	HEM2	P05373	342 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	OPI3	P05375	206 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	GAL7	P08431	366 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	CLN3	P13365	580 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SPS22	P25380	463 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	NDC1	P32500	655 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YEF1	P32622	495 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	MNS1	P32906	549 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	VAM7	P32912	316 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	PMU1	P36069	295 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	AVT5	P38176	459 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	PEX18	P38855	283 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	ALP1	P38971	573 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	END3	P39013	349 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	TOS3	P43637	560 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YHC3	P47040	408 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	RTT101	P47050	842 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	PHB2	P50085	310 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	AVT4	P50944	713 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	STE23	Q06010	1027 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	CUR1	Q06469	252 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	ARR1	Q06596	294 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YLR413W	Q06689	675 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	NDE2	Q07500	545 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	RAX1	Q08760	435 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	RSA1	Q08932	381 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	NCA2	Q12374	616 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	APC2	Q12440	853 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	RGS2	Q99188	309 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YCL068C	P25593	260 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	TOA2	P32774	122 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SWC5	P38326	303 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SPT8	P38915	602 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	FAA2	P39518	744 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	AIM20	P40451	204 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SIM1	P40472	476 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	RPR2	P40571	144 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	AZR1	P50080	613 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	VOA1	P53262	265 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	SPO19	Q03029	223 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	BCH1	Q05029	724 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	RRG8	Q06109	277 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	ASA1	Q06822	443 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YOR012W	Q12351	137 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	YOP1	Q12402	180 aa		2.72	□□□□□ -1.97
AIM4	YBR194W	POM152	P39685	1337 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	YLL053C	P0CD98	152 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	CBS2	P14905	389 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	CHK1	P38147	527 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	MIX23	P38162	196 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	RTC2	P38279	296 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	PEX32	P38292	413 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	YBP1	P38315	674 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	PET100	P38958	111 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	RRN9	P53437	365 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	SPR6	Q01684	191 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	PIR3	Q03180	325 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	CAB5	Q03941	241 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	APC4	Q04601	652 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	ERV41	Q04651	352 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	VAC14	Q06708	880 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	YCR022C	P25620	114 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	ITR1	P30605	584 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	AGA1	P32323	725 aa		2.7	□□□□□ -1.98
AIM4	YBR194W	RIB5	P38145	238 aa		2.7	□□□□□ -1.98

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