RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637887.1

ARID1B-231, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5

Gene ARID1B, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-231	ENST00000637887	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	FAM153B	P0C7A2	387 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	TNFRSF1A	P19438	455 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	ATP2B1	P20020	1258 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	EXOC2	Q96KP1	924 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	AQP7	O14520	342 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	MATN3	O15232	486 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	CHGB	P05060	677 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	CD248	Q9HCU0	757 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	PYGM	P11217	842 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	CSF2RB	P32927	897 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	GUCY1A3	Q02108	690 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	CDSN	Q15517	529 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	GPR19	Q15760	415 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	SLFN13	Q68D06	897 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	OSTM1	Q86WC4	334 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	FBXW5	Q969U6	566 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	AJUBA	Q96IF1	538 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	CBLC	Q9ULV8	474 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	AMY2A	P04746	511 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	PDE6A	P16499	860 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	KRT15	P19012	456 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	AMY2B	P19961	511 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25	5e-14	■■■■□ 21.3
ARID1B-231	ENST00000637887	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	DNER	Q8NFT8	737 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887		H0Y858	1186 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	MAN2B1	O00754	1011 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	WNT9A	O14904	365 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	SPRED1	Q7Z699	444 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	NBPF4	Q96M43	638 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	ARVCF	O00192	962 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	KCNK3	O14649	394 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	JAM2	P57087	298 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	ZXDA	P98168	799 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	GNRHR2	Q96P88	292 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	KATNBL1	Q9H079	304 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	KLC2	Q9H0B6	622 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	ERCC6	Q03468	1493 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	CRTAM	O95727	393 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	GABRE	P78334	506 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	PALM2	Q8IXS6	379 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	DEF6	Q9H4E7	631 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	ESYT3	A0FGR9	886 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	PATE3	B3GLJ2	98 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	DNM2	P50570	870 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	ST5	P78524	1137 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ARID1B-231	ENST00000637887	SERINC3	Q13530	473 aa		7.23	□□□□□ -1.25

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