RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 STAT5BP51692 787 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 PSMC5P62195 406 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 LRRC41Q15345 812 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 POTEBQ6S5H4 581 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 POTEGQ6S5H5 508 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 TRIM50Q86XT4 487 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 TPH2Q8IWU9 490 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 FSIP1Q8NA03 581 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 NEK9Q8TD19 979 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 CALML4Q96GE6 196 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 PCYT2Q99447 389 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 PLIN2Q99541 437 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 LXNQ9BS40 222 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 PANK2Q9BZ23 570 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 TUFT1Q9NNX1 390 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 SLITRK3O94933 977 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 TFRCP02786 760 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 ASGR1P07306 291 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 PFKFB1P16118 471 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 MARK3P27448 753 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 CST5P28325 142 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 CHMP4BP1P59074 171 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 UBE2HP62256 183 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 NKX3-2P78367 333 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 PURAQ00577 322 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 KCNA10Q16322 511 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 ECM1Q16610 540 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 PDILTQ8N807 584 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 KLHDC9Q8NEP7 349 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 AFAP1L1Q8TED9 768 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 PNMA5Q96PV4 448 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 A0A087WWV3 80 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 A0A087X0B3 334 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 KBTBD13C9JR72 458 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 H3BRB1 525 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 SLC26A4O43511 780 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF862O60290 1169 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 KPNA6O60684 536 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 SGPL1O95470 568 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 F2P00734 622 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 OATP04181 439 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 GJB1P08034 283 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 PLCG1P19174 1290 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 ATP4AP20648 1035 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 MCM4P33991 863 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 STAT6P42226 847 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 NDUFA8P51970 172 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 ACLYP53396 1101 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 PSMC6P62333 389 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 PRKCEQ02156 737 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 GRB10Q13322 594 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 HYIQ5T013 277 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 DHX58Q96C10 678 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 OGDHLQ9ULD0 1010 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 KCNH3Q9ULD8 1083 aa9.52□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.52□□□□□ -0.89
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