RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 IKBKEQ14164 716 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 RILPL1Q5EBL4 403 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 BANK1Q8NDB2 785 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 TBCKQ8TEA7 893 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PRRX2Q99811 253 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 CCND2P30279 289 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP4P98171 946 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PKP1Q13835 747 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 TCTN1Q2MV58 587 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PCNX4Q63HM2 1172 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM117BQ6P1L5 589 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 MOXD1Q6UVY6 613 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 NEK8Q86SG6 692 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 FERMT3Q86UX7 667 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 CRYGNQ8WXF5 182 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 TECTAO75443 2155 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 EDNRBP24530 442 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PGM5Q15124 567 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 SESTD1Q86VW0 696 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 NR3C2P08235 984 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 CHMP4BP1P59074 171 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 INF2Q27J81 1249 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 MYSM1Q5VVJ2 828 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 EP400NLQ6ZTU2 488 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 SCFD2Q8WU76 684 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 PGBD1Q96JS3 809 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 SAMD11Q96NU1 681 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 MUTYHQ9UIF7 546 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 ZDHHC9Q9Y397 364 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 SPTBN4Q9H254 2564 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 CKBP12277 381 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 CIITAP33076 1130 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 TCEAL5Q5H9L2 206 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 ATL3Q6DD88 541 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 VSIG10LQ86VR7 867 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 PDE4DQ08499 809 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 STXBP2Q15833 593 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 EPC2Q52LR7 807 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 IER5LQ5T953 404 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP4R3AQ6IN85 833 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 NIPA1Q7RTP0 329 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 EDAQ92838 391 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 H3BNC9 293 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 NCK2O43639 380 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP3A7P24462 503 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 COPS5Q92905 334 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 C5orf42Q9H799 3197 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM205CA6NFA0 338 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 TXNP10599 105 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF76P36508 570 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 TTC38Q5R3I4 469 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF135Q8IUD6 432 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 CLDND1Q9NY35 253 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 CACNA1HO95180 2353 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 MYH7BA7E2Y1 1941 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 BMP15O95972 392 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 SETQ01105 290 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 GPM6BQ13491 265 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 LETM2Q2VYF4 491 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 GNPTABQ3T906 1256 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 IL31RAQ8NI17 732 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 MBOAT7Q96N66 472 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO7AQ13402 2215 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 MAFGO15525 162 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 GFRA3O60609 400 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 AMHP03971 560 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 LTBRP36941 435 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 TCF15Q12870 199 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP55Q53EZ4 464 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 NLRX1Q86UT6 975 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 PBXIP1Q96AQ6 731 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 CDHR1Q96JP9 859 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-214ENST00000592483 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 Q4G0T1 1027 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 GPRASP2Q96D09 838 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MXRA8Q9BRK3 442 aa26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms