RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588335.1

GRIN3B-202, Transcript of glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3B, humanhuman

TSL 3

Gene GRIN3B, Length 528 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3B-202ENST00000588335 RNPEPQ9H4A4 650 aa15.22■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 GABBR1Q9UBS5 961 aa15.22■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 VAV3Q9UKW4 847 aa15.22■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 POTEB3A0JP26 581 aa15.21■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 OR52Z1P0C646 297 aa15.21■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 HOXC8P31273 242 aa15.21■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 TXKP42681 527 aa15.21■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 PTK7Q13308 1070 aa15.21■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 PLCB4Q15147 1175 aa15.21■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 TMEM266Q2M3C6 531 aa15.21■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 POTEBQ6S5H4 581 aa15.21■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 ATP8B4Q8TF62 1192 aa15.21■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 MTMR9Q96QG7 549 aa15.21■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 RAB34Q9BZG1 259 aa15.21■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 CEP131Q9UPN4 1083 aa15.21■□□□□ 0.03
GRIN3B-202ENST00000588335 WDR81Q562E7 1941 aa15.21■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 PITPNM1O00562 1244 aa15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 WNT7AO00755 349 aa15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 BMP15O95972 392 aa15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 P4HBP07237 508 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 ITGB8P26012 769 aa15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 GRIN2CQ14957 1233 aa15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 EPHA7Q15375 998 aa15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 GRIK4Q16099 956 aa15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 TMEM199Q8N511 208 aa15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 RETREG2Q8NC44 543 aa15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 NRBP2Q9NSY0 501 aa15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 SETD4Q9NVD3 440 aa15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 COL1A2P08123 1366 aa15.2■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 CYP2C9P11712 490 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 INSRRP14616 1297 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 DNAJB2P25686 324 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 QARSP47897 775 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 EPHB4P54760 987 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 PSMC5P62195 406 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 FPGSQ05932 587 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 PTGDRQ13258 359 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 ZNF484Q5JVG2 852 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 NCAPH2Q6IBW4 605 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 MFSD5Q6N075 450 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 TAF2Q6P1X5 1199 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 RSPH3Q86UC2 560 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 FERMT3Q86UX7 667 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 SERINC5Q86VE9 423 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 NEK9Q8TD19 979 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 LMBR1Q8WVP7 490 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 TMEM60Q9H2L4 133 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 ZNF576Q9H609 170 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 TUBE1Q9UJT0 475 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 MTMR6Q9Y217 621 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 STK24Q9Y6E0 443 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 NCOR1O75376 2440 aa15.19■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 CAND2O75155 1236 aa15.18■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 OATP04181 439 aa15.18■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 PRPHP41219 470 aa15.18■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 PRKCEQ02156 737 aa15.18■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 SPIRE1Q08AE8 756 aa15.18■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 XKR3Q5GH77 459 aa15.18■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 USP38Q8NB14 1042 aa15.18■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 ERMNQ8TAM6 284 aa15.18■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 EML1O00423 815 aa15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 TREHO43280 583 aa15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 TECP42680 631 aa15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 IGBP1P78318 339 aa15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 ADAM17P78536 824 aa15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 RBL2Q08999 1139 aa15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 NBR1Q14596 966 aa15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 DTHD1Q6ZMT9 781 aa15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 C4orf32Q8N8J7 132 aa15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 TIFAQ96CG3 184 aa15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.17■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 BDP1A6H8Y1 2624 aa15.16■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 MAGEB2O15479 319 aa15.16■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 ZNF862O60290 1169 aa15.16■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 ATP4AP20648 1035 aa15.16■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 CYP2C18P33260 490 aa15.16■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 RFC2P35250 354 aa15.16■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 THPOP40225 353 aa15.16■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
GRIN3B-202ENST00000588335 RESTQ13127 1097 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms