RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	PSMC5	P62195	406 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	TPH2	Q8IWU9	490 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	RGL1	Q9NZL6	768 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	27.97	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	RAG1	P15918	1043 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	ATP4A	P20648	1035 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	PRPH	P41219	470 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	27.97	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	HIC1	Q14526	733 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	TREH	O43280	583 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF862	O60290	1169 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	NEK9	Q8TD19	979 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	USP28	Q96RU2	1077 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	HIPK3	Q9H422	1215 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	TCHH	Q07283	1943 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	BRD1	O95696	1058 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	TBX21	Q9UL17	535 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229		H0YGN5	161 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	STK38	Q15208	465 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	MTERF2	Q49AM1	385 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	COL1A2	P08123	1366 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	SCN5A	Q14524	2016 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM150B	A6NC51	233 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	PTK7	Q13308	1070 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	IL17A	Q16552	155 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	XKR3	Q5GH77	459 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA0355	O15063	1070 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	HOXC8	P31273	242 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	BFSP2	Q13515	415 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	PP2D1	A8MPX8	630 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	SLITRK3	O94933	977 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	CYP2C18	P33260	490 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	PDIA5	Q14554	519 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	KRT79	Q5XKE5	535 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	SERINC5	Q86VE9	423 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	RETREG2	Q8NC44	543 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	MED24	O75448	989 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	TIMP1	P01033	207 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	CDC25A	P30304	524 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	THPO	P40225	353 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	CCL23	P55773	120 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	NUCB2	P80303	420 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	PTPA	Q15257	358 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	C4orf19	Q8IY42	314 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	BAD	Q92934	168 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	STK24	Q9Y6E0	443 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	KLRC1	P26715	233 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	POTEG	Q6S5H5	508 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	METTL13	Q8N6R0	699 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-223	ENST00000584229	CAGE1	Q8TC20	777 aa		27.89	■■■□□ 2.06

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