RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD62	A6NC57	917 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	KRIT1	O00522	736 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	TADA3	O75528	432 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	LTF	P02788	710 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	AMY2A	P04746	511 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	AMY2B	P19961	511 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	VIPR1	P32241	457 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	MAPKAPK2	P49137	400 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	GPR19	Q15760	415 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM177	Q53S58	311 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	XP32	Q5T750	250 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	TMC6	Q7Z403	805 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	TESK2	Q96S53	571 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CD244	Q9BZW8	370 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SPC25	Q9HBM1	224 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	DSE	Q9UL01	958 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	USP47	Q96K76	1375 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	MED14	O60244	1454 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ALK	Q9UM73	1620 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	IFT172	Q9UG01	1749 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	TRAF5	O00463	557 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC6	O75061	913 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SLC6A11	P48066	632 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	GRIN1	Q05586	938 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	EMC4	Q5J8M3	183 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	NXPE1	Q8N323	547 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PRAM1	Q96QH2	718 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	MYOT	Q9UBF9	498 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ABCC11	Q96J66	1382 aa		6	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ADGRB1	O14514	1584 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ABLIM1	O14639	778 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB7A	O95365	584 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	NPTXR	O95502	500 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	NCKAP1L	P55160	1127 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	TUSC3	Q13454	348 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CHRNA2	Q15822	529 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	MCTP1	Q6DN14	999 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	AHI1	Q8N157	1196 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ALG3	Q92685	438 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SGPP1	Q9BX95	441 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	POGK	Q9P215	609 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PTPRU	Q92729	1446 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CBX4	O00257	560 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	MAN2B1	O00754	1011 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	MAFK	O60675	156 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	KRT37	O76014	449 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CNGA1	P29973	690 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SLC9A5	Q14940	896 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	RNF180	Q86T96	592 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		5.98	□□□□□ -1.45

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms