RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 SEPT8Q92599 483 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 WNT8BQ93098 351 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 SAMD11Q96NU1 681 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 XBP1P17861 261 aa22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 HIC1Q14526 733 aa22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 TCTN1Q2MV58 587 aa22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM50Q86XT4 487 aa22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 TMX3Q96JJ7 454 aa22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 PTPRSQ13332 1948 aa22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 CYP3A7P24462 503 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 NR5A1Q13285 461 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 PRR16Q569H4 304 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 SPRED2Q7Z698 418 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 MBOAT7Q96N66 472 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 UIMC1Q96RL1 719 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM205CA6NFA0 338 aa22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 CCNE2O96020 404 aa22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 MMP1P03956 469 aa22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 FOSBP53539 338 aa22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 PTPROQ16827 1216 aa22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 PCYT2Q99447 389 aa22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 TREHO43280 583 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 TDP2O95551 362 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 ACTR2P61160 394 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 INF2Q27J81 1249 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 APBB2Q92870 758 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 BTBD18B2RXH4 712 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 MSH4O15457 936 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 ATG7O95352 703 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 KRT2P35908 639 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 Q4G0T1 1027 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 SDF4Q9BRK5 362 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 MCM2P49736 904 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 TOP1MTQ969P6 601 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 YME1L1Q96TA2 773 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 WDR81Q562E7 1941 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 NRCAMQ92823 1304 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 GUCY1B3Q02153 619 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC5A5Q92911 643 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 GJA10Q969M2 543 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 SETD4Q9NVD3 440 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC37A4O43826 429 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM26DQ5JW98 314 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 NEK8Q86SG6 692 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM122AQ96E09 287 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 C8orf76Q96K31 380 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 SIP14410 1827 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 KAT6AQ92794 2004 aa22.64■■□□□ 1.22
RABGGTA-210ENST00000559586 WNT7AO00755 349 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 CTSHP09668 335 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 PLA2G5P39877 138 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 ADAM17P78536 824 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 LETM2Q2VYF4 491 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 EPC2Q52LR7 807 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms