RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 TPCN1Q9ULQ1 816 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 LOC100996750A0A140TA64 210 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 STXBP3O00186 592 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 CPLX1O14810 134 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 ARIH2O95376 493 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 SCG2P13521 617 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 ITGA7Q13683 1181 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 PKN1Q16512 942 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 LY6KQ17RY6 165 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 DUSP28Q4G0W2 176 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 VSIG10LQ86VR7 867 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 SCFD2Q8WU76 684 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 IL17RAQ96F46 866 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 C22orf23Q9BZE7 217 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 CACNA1AO00555 2505 aa11.02□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 USP34Q70CQ2 3546 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 PIK3CDO00329 1044 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 SORBS3O60504 671 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 LPXNO60711 386 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 ALADP13716 330 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 IFNAR1P17181 557 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 CCND2P30279 289 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 PSMC6P62333 389 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 SCRN1Q12765 414 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 ANKRD1Q15327 319 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 CCDC62Q6P9F0 684 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 FAM178BQ8IXR5 827 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 NECAB1Q8N987 351 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 OR6J1Q8NGC5 347 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 GDPD5Q8WTR4 605 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 PGBD1Q96JS3 809 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 RIC8AQ9NPQ8 531 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 TMEM260Q9NX78 707 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 BARHL2Q9NY43 387 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 Q9Y3F1 56 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 MRVI1Q9Y6F6 885 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 GRIN2DO15399 1336 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 NID2Q14112 1375 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 ZNF318Q5VUA4 2279 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 SPDYE3A6NKU9 549 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 ADAMTS3O15072 1205 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 PFKFB2O60825 505 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 CABYRO75952 493 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 PFKMP08237 780 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 ADCY7P51828 1080 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 ME3Q16798 604 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 SLC9A7Q96T83 725 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 KIF2CQ99661 725 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 TANC1Q9C0D5 1861 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 PTPRSQ13332 1948 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 KIF28PB7ZC32 967 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 ZEB2O60315 1214 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 LARGE1O95461 756 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 MYL3P08590 195 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 CYP2C9P11712 490 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 ACTN1P12814 892 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 IL9P15248 144 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 KCNA5P22460 613 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 NKX3-2P78367 333 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 SP2Q02086 613 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 HERC6Q8IVU3 1022 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 TRIM22Q8IYM9 498 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 AIFM3Q96NN9 605 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 BCAS3Q9H6U6 928 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 VPS54Q9P1Q0 977 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 CFAP54Q96N23 3096 aa11□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 DCXO43602 365 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 GH1P01241 217 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 RBM25P49756 843 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 CHMP4BP1P59074 171 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 ARHGAP1Q07960 439 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CS-217ENST00000550044 PCNX4Q63HM2 1172 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms