RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531546.1

CASP4-210, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 2

Gene CASP4, Length 921 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-210ENST00000531546 NFATC3Q12968 1075 aa7.34□□□□□ -1.23
CASP4-210ENST00000531546 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CASP4-210ENST00000531546 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.34□□□□□ -1.23
CASP4-210ENST00000531546 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.34□□□□□ -1.23
CASP4-210ENST00000531546 TET3O43151 1660 aa7.34□□□□□ -1.23
CASP4-210ENST00000531546 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.34□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 BCL6P41182 706 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 EMC4Q5J8M3 183 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 STEAP3Q658P3 488 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.33□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.33□□□□□ -1.24
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CASP4-210ENST00000531546 H7BY64 318 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 Q8TCH9 128 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 GPRASP2Q96D09 838 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 ZNF341Q9BYN7 854 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.32□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 CCDC141Q6ZP82 1450 aa7.31□□□□□ -1.24
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CASP4-210ENST00000531546 PTCH1Q13635 1447 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 NCAPHQ15003 741 aa7.31□□□□□ -1.24
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CASP4-210ENST00000531546 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.3□□□□□ -1.24
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CASP4-210ENST00000531546 TADA3O75528 432 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 TGFB2P61812 414 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 CCDC103Q8IW40 242 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 CHD4Q14839 1912 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 MTUS2Q5JR59 1369 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 LRG1P02750 347 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 VAMP1P23763 118 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 HOXC12P31275 282 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 PURAQ00577 322 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 CYP4F3Q08477 520 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 MYOTQ9UBF9 498 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 MBD5Q9P267 1494 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 GLI3P10071 1580 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 MST1RQ04912 1400 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 CEP162Q5TB80 1403 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 ADGRB3O60242 1522 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 DGKIO75912 1065 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 LSAMPQ13449 338 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 FHL2Q14192 279 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 TESK1Q15569 626 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.28□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CASP4-210ENST00000531546 RGPD1P0DJD0 1748 aa7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 RECKO95980 971 aa7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 CPP00450 1065 aa7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 CHGBP05060 677 aa7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 SCG5P05408 212 aa7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 TSPY4P0CV99 314 aa7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 TSPY10P0CW01 314 aa7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 IDI1Q13907 227 aa7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 CYP4F22Q6NT55 531 aa7.27□□□□□ -1.25
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CASP4-210ENST00000531546 SPON1Q9HCB6 807 aa7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 DLL4Q9NR61 685 aa7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 MYO5BQ9ULV0 1848 aa7.27□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.26□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 COL6A1P12109 1028 aa7.26□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 LTBRP36941 435 aa7.26□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 ECI1P42126 302 aa7.26□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 ABHD18Q0P651 414 aa7.26□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 MIIPQ5JXC2 388 aa7.26□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 VASNQ6EMK4 673 aa7.26□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 UNC5CLQ8IV45 518 aa7.26□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.26□□□□□ -1.25
CASP4-210ENST00000531546 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
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