RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529728.5

SERGEF-212, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 5

Gene SERGEF, Length 1,396 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-212ENST00000529728 FOSBP53539 338 aa28.41■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 FAM26DQ5JW98 314 aa28.41■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 PDXDC2PQ6P474 469 aa28.41■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 RUFY4Q6ZNE9 571 aa28.41■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 FAM20AQ96MK3 541 aa28.41■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 TRPC6Q9Y210 931 aa28.41■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 COL1A2P08123 1366 aa28.41■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 ZBTB42B2RXF5 422 aa28.4■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 HBP1O60381 514 aa28.4■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 JAK3P52333 1124 aa28.4■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 CUL4AQ13619 759 aa28.4■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 HAS1Q92839 578 aa28.4■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 VAV3Q9UKW4 847 aa28.4■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 RSPH10B2B2RC85 870 aa28.39■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 RSPH10BP0C881 870 aa28.39■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 GUCY1B3Q02153 619 aa28.39■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 GABBR1Q9UBS5 961 aa28.39■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
SERGEF-212ENST00000529728 WNT7AO00755 349 aa28.38■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 PPP2R5CQ13362 524 aa28.38■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 POTEDQ86YR6 584 aa28.38■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 FAM184AQ8NB25 1140 aa28.38■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa28.38■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 CHD9Q3L8U1 2897 aa28.38■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 ZNF862O60290 1169 aa28.37■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 BAIAP3O94812 1187 aa28.37■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 ACTN1P12814 892 aa28.37■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 MGAT3Q09327 533 aa28.37■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa28.37■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 SAMM50Q9Y512 469 aa28.37■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 CHMP2AO43633 222 aa28.37■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 IGBP1P78318 339 aa28.37■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 TCTN1Q2MV58 587 aa28.37■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 ZNF484Q5JVG2 852 aa28.37■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 CNKSR3Q6P9H4 555 aa28.37■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 ZBTB10Q96DT7 871 aa28.37■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 SPIRE1Q08AE8 756 aa28.36■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 UGCGQ16739 394 aa28.36■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 MTHFD1LQ6UB35 978 aa28.36■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 MIER3Q7Z3K6 550 aa28.36■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 OSBPL7Q9BZF2 842 aa28.36■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP28.36■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa28.35■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 CHRNA1P02708 482 aa28.35■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 CTSHP09668 335 aa28.35■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa28.35■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 DNAJB3Q8WWF6 145 aa28.35■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 FAM167AQ96KS9 214 aa28.35■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa28.35■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 COL6A3P12111 3177 aa28.34■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 CHD7Q9P2D1 2997 aa28.34■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 GRXCR1A8MXD5 290 aa28.34■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 EML1O00423 815 aa28.34■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 SLFN12Q8IYM2 578 aa28.34■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 TMEM265A0A087WTH1 108 aa28.33■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 STBD1O95210 358 aa28.33■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.132e-6■□□□□ 9.6
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SERGEF-212ENST00000529728 RSPH3Q86UC2 560 aa28.33■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 PBX4Q9BYU1 374 aa28.33■■■□□ 2.13
SERGEF-212ENST00000529728 ARID2Q68CP9 1835 aa28.32■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 KIF28PB7ZC32 967 aa28.32■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa28.32■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 C22orf31O95567 290 aa28.32■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 OATP04181 439 aa28.32■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 KLRC1P26715 233 aa28.32■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 NOSTRINQ8IVI9 506 aa28.32■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 CKAP2LQ8IYA6 745 aa28.32■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa28.32■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 MTMR9Q96QG7 549 aa28.32■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 SLC9A7Q96T83 725 aa28.32■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.32■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 KIF3AQ9Y496 699 aa28.32■■■□□ 2.12
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SERGEF-212ENST00000529728 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 Q7L0L9 218 aa28.31■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 DBF4BQ8NFT6 615 aa28.31■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa28.3■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 NEMFO60524 1076 aa28.3■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 EFCAB14O75071 495 aa28.3■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 GJB2P29033 226 aa28.3■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 PBX2P40425 430 aa28.3■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
SERGEF-212ENST00000529728 NME8Q8N427 588 aa28.3■■■□□ 2.12
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