RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492417.5

TRA2B-215, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 1 (best)

Gene TRA2B, Length 4,141 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-215	ENST00000492417	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MYH3	P11055	1940 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CETN3	O15182	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PPP6R2	O75170	966 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GNAT1	P11488	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CYP2C9	P11712	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PRKCE	Q02156	737 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	STK24	Q9Y6E0	443 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CEP290	O15078	2479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MEIS2	O14770	477 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FOXN1	O15353	648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC10A3	P09131	477 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	AKR1A1	P14550	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SFN	P31947	248 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SOX10	P56693	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TRPC3	Q13507	836 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LAMC2	Q13753	1193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TFDP1	Q14186	410 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	EPHA7	Q15375	998 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	DDX12P	Q92771	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	AK8	Q96MA6	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ESYT2	A0FGR8	921 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417		H3BRB1	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ATP9A	O75110	1047 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PTGS1	P23219	599 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62	1e-15	■□□□□ 8.6
TRA2B-215	ENST00000492417	CLCN3	P51790	818 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	OAZ1	P54368	228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM193A	P78312	1265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CUL4B	Q13620	913 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ZBTB39	O15060	712 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	DDIT3	P35638	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SREBF1	P36956	1147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	THPO	P40225	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CPT1A	P50416	773 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	DNA2	P51530	1060 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	UBASH3A	P57075	661 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TAF12	Q16514	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	USP37	Q86T82	979 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PARVG	Q9HBI0	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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