RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 BANK1Q8NDB2 785 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 ATP8B4Q8TF62 1192 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 SH2D3AQ9BRG2 576 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 IL23AQ9NPF7 189 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 KIF3AQ9Y496 699 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 EVPLQ92817 2033 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 HBP1O60381 514 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 NBNO60934 754 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 CTSHP09668 335 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 GNAT1P11488 350 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 SELPP16109 830 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 SFNP31947 248 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 JAK3P52333 1124 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 PRKCEQ02156 737 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 RBL2Q08999 1139 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP13.66□□□□□ -0.224e-7■■■■□ 19.6
NISCH-210ENST00000488157 NCAPH2Q6IBW4 605 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 LRRC8DQ7L1W4 858 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 C4orf32Q8N8J7 132 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 CAGE1Q8TC20 777 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 RGL1Q9NZL6 768 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 TUBE1Q9UJT0 475 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 SIP14410 1827 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 RRN3P2A6NIE6 340 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 BAG4O95429 457 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 KLRC1P26715 233 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 SLC26A2P50443 739 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 MTHFD1LQ6UB35 978 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 OTOP2Q7RTS6 562 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 FERMT3Q86UX7 667 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 HSCBQ8IWL3 235 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 SLFN12Q8IYM2 578 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 RDM1Q8NG50 284 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 DYDC2Q96IM9 177 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 PCDHA12Q9UN75 941 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-210ENST00000488157 A0A087WWV3 80 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 POTEMA6NI47 508 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 ZBTB39O15060 712 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 CHRNA1P02708 482 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 OATP04181 439 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 SYT1P21579 422 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 CYP4A11Q02928 519 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 TMEM62Q0P6H9 643 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 EPHA7Q15375 998 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 CCDC155Q8N6L0 562 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 LRCH3Q96II8 777 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 A0A1W2PPC1 479 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 DDX11L8A8MPP1 907 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 GRXCR1A8MXD5 290 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 RSPH10B2B2RC85 870 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 C22orf31O95567 290 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 FGBP02675 491 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 OR52Z1P0C646 297 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 RSPH10BP0C881 870 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 TECP42680 631 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 TRAPPC10P48553 1259 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 MGAT3Q09327 533 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 PTGDRQ13258 359 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 IL17AQ16552 155 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 ZNF484Q5JVG2 852 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 PLA2G4FQ68DD2 849 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 FAM173BQ6P4H8 233 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 ANO5Q75V66 913 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 CEP89Q96ST8 783 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 COL1A2P08123 1366 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 SLITRK3O94933 977 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 P4HBP07237 508 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 QARSP47897 775 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 NPEPPSP55786 919 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 PSMC5P62195 406 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 MTERF2Q49AM1 385 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 FAM26DQ5JW98 314 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 RASIP1Q5U651 963 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-210ENST00000488157 LRRC71Q8N4P6 559 aa13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms