RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486066.5

CHRD-216, Transcript of chordin, humanhuman

TSL 4

Gene CHRD, Length 546 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRD-216ENST00000486066 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.15■■□□□ 1.14
CHRD-216ENST00000486066 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 UBE3AQ05086 875 aa22.14■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 IER5Q5VY09 327 aa22.14■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.14■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.14■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 FSCN2O14926 492 aa22.13■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 STAG3L1P0CL83 205 aa22.13■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 PTH1RQ03431 593 aa22.13■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 TRDNQ13061 729 aa22.13■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 DUSP6Q16828 381 aa22.13■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.13■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 GLG1Q92896 1179 aa22.13■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 S1PR5Q9H228 398 aa22.13■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 E7EWF7 191 aa22.12■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 MAFGO15525 162 aa22.12■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 MGEA5O60502 916 aa22.12■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 IGBP1P78318 339 aa22.12■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 MTMR1Q13613 665 aa22.12■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.12■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 CUL5Q93034 780 aa22.12■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 JADE2Q9NQC1 790 aa22.12■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 FAM186AA6NE01 2351 aa22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 ERVFC1P60507 584 aa22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 PAK2Q13177 524 aa22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 PLCB4Q15147 1175 aa22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 TLE6Q9H808 572 aa22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 LY9Q9HBG7 655 aa22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 EVPLQ92817 2033 aa22.11■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 MYO10Q9HD67 2058 aa22.1■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 ERICH2A1L162 156 aa22.1■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 PER2O15055 1255 aa22.1■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 DDAH1O94760 285 aa22.1■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 AVPR2P30518 371 aa22.1■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 PTPN21Q16825 1174 aa22.1■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.1■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.1■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 NCOA7Q8NI08 942 aa22.1■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 TLR9Q9NR96 1032 aa22.1■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 HCSTQ9UBK5 93 aa22.1■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 FSD2A1L4K1 749 aa22.09■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.09■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 NME8Q8N427 588 aa22.09■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.09■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 MYL10Q9BUA6 226 aa22.09■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.09■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 ZNF292O60281 2723 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 NFASCO94856 1347 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 C9IYK1 514 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 PROB1E7EW31 1015 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 GFRA3O60609 400 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 ATG7O95352 703 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 CWH43Q9H720 699 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 RGS18Q9NS28 235 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.08■■□□□ 1.13
CHRD-216ENST00000486066 CACNA1AO00555 2505 aa22.07■■□□□ 1.12
CHRD-216ENST00000486066 FGF18O76093 207 aa22.07■■□□□ 1.12
CHRD-216ENST00000486066 NUBP1P53384 320 aa22.07■■□□□ 1.12
CHRD-216ENST00000486066 KRT76Q01546 638 aa22.07■■□□□ 1.12
CHRD-216ENST00000486066 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CHRD-216ENST00000486066 UBE2SQ16763 222 aa22.07■■□□□ 1.12
CHRD-216ENST00000486066 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.07■■□□□ 1.12
CHRD-216ENST00000486066 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CHRD-216ENST00000486066 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.07■■□□□ 1.12
CHRD-216ENST00000486066 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CHRD-216ENST00000486066 NEK1Q96PY6 1258 aa22.07■■□□□ 1.12
CHRD-216ENST00000486066 MTA3Q9BTC8 594 aa22.07■■□□□ 1.12
CHRD-216ENST00000486066 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.07■■□□□ 1.12
CHRD-216ENST00000486066 LZTS1Q9Y250 596 aa22.07■■□□□ 1.12
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