RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-208	ENST00000484101	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		10.64	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	REEP2	Q9BRK0	252 aa		10.64	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		10.64	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		10.64	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		10.64	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		10.64	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	PARVG	Q9HBI0	331 aa		10.64	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	RNF146	Q9NTX7	359 aa		10.64	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	FBXO40	Q9UH90	709 aa		10.64	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	CSAD	Q9Y600	493 aa		10.64	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	PFAS	O15067	1338 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	SLITRK3	O94933	977 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	SCP2	P22307	547 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	NF2	P35240	595 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	KRT83	P78385	493 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	NOG	Q13253	232 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	PGM5	Q15124	567 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	ARSH	Q5FYA8	562 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	SULF1	Q8IWU6	871 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	CPXCR1	Q8N123	301 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	CHST13	Q8NET6	341 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	REPS2	Q8NFH8	660 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	DYDC2	Q96IM9	177 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	IWS1	Q96ST2	819 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	RMDN3	Q96TC7	470 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	LXN	Q9BS40	222 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	ACAD9	Q9H845	621 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	PXMP2	Q9NR77	195 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101		A0A0C4DFX4	3053 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	WDR81	Q562E7	1941 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	NFASC	O94856	1347 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	TTC26	A0AVF1	554 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	WDR64	B1ANS9	1081 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	EML1	O00423	815 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	KIF5C	O60282	957 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	ITGB5	P18084	799 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	EPS15	P42566	896 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	HMGCS2	P54868	508 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	TUBB4B	P68371	445 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	MAP3K9	P80192	1104 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	CYP4A11	Q02928	519 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	SFR1	Q86XK3	245 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	TPH2	Q8IWU9	490 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	DNER	Q8NFT8	737 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	TBC1D5	Q92609	795 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF592	Q92610	1267 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	GJA10	Q969M2	543 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	ATG4C	Q96DT6	458 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	ERO1A	Q96HE7	468 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	DNAI1	Q9UI46	699 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UFD1-208	ENST00000484101	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71

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