RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, human

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHQ1-208	ENST00000482785	PTS	Q03393	145 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	TNP2	Q05952	138 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PPIL2	Q13356	520 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	NEUROD1	Q13562	356 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PCSK7	Q16549	785 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SULF2	Q8IWU5	870 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	LPAR1	Q92633	364 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	GATA6	Q92908	595 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	MUC3B	Q9H195	1237 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SENP2	Q9HC62	589 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	MARK1	Q9P0L2	795 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	F8	P00451	2351 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	NUP98	P52948	1817 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785		B2RBV5	119 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	MBTPS2	O43462	519 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	FGB	P02675	491 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	THBS1	P07996	1170 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	GPSM2	P81274	684 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CCL14	Q16627	93 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PERM1	Q5SV97	790 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	JAML	Q86YT9	394 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	BHMT	Q93088	406 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	KIFC2	Q96AC6	838 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CBX8	Q9HC52	389 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785		A0A087X0B3	334 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CLRN2	A0PK11	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SLC35F4	A4IF30	521 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PI15	O43692	258 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	LTBR	P36941	435 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	EPHB1	P54762	984 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	EYA3	Q99504	573 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785		A0A1B0GUL6	1792 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHQ1-208	ENST00000482785	MTOR	P42345	2549 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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