RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 VTI1AQ96AJ9 217 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP1-207ENST00000471650 LENG9Q96B70 501 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP1-207ENST00000471650 WDR11Q9BZH6 1224 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP1-207ENST00000471650 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
SH3BP1-207ENST00000471650 SUGCTQ9HAC7 445 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP1-207ENST00000471650 PDGFCQ9NRA1 345 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM186AA6NE01 2351 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP1-207ENST00000471650 TPRP12270 2363 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
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SH3BP1-207ENST00000471650 BEX3Q00994 111 aa12.15□□□□□ -0.46
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SH3BP1-207ENST00000471650 GNPTABQ3T906 1256 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP1-207ENST00000471650 PRR16Q569H4 304 aa12.15□□□□□ -0.46
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SH3BP1-207ENST00000471650 IQSEC1Q6DN90 963 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM173BQ6P4H8 233 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP1-207ENST00000471650 KCNV1Q6PIU1 500 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP1-207ENST00000471650 PLA2G4DQ86XP0 818 aa12.15□□□□□ -0.46
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SH3BP1-207ENST00000471650 PRRX2Q99811 253 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP1-207ENST00000471650 CHMP5Q9NZZ3 219 aa12.15□□□□□ -0.46
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SH3BP1-207ENST00000471650 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
SH3BP1-207ENST00000471650 MTUS1Q9ULD2 1270 aa12.15□□□□□ -0.46
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SH3BP1-207ENST00000471650 SLC37A4O43826 429 aa12.14□□□□□ -0.47
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SH3BP1-207ENST00000471650 ARP10275 920 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 TGFB3P10600 412 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 SETQ01105 290 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 MTMR1Q13613 665 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 NBR1Q14596 966 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC144BQ3MJ40 725 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC62Q6P9F0 684 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 CXCL17Q6UXB2 119 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 SCFD2Q8WU76 684 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 KCNH7Q9NS40 1196 aa12.14□□□□□ -0.47
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SH3BP1-207ENST00000471650 FAM184BQ9ULE4 1060 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 PRR23AA6NEV1 266 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 MSH4O15457 936 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 ARIH2O95376 493 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 TXNP10599 105 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 SMPD1P17405 629 aa12.13□□□□□ -0.47
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SH3BP1-207ENST00000471650 GJA9P57773 515 aa12.13□□□□□ -0.47
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SH3BP1-207ENST00000471650 ADHFE1Q8IWW8 467 aa12.13□□□□□ -0.47
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SH3BP1-207ENST00000471650 SLC9A7Q96T83 725 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 SENP7Q9BQF6 1050 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 LMCD1Q9NZU5 365 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa12.13□□□□□ -0.47
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SH3BP1-207ENST00000471650 MYH15Q9Y2K3 1946 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 ATRXP46100 2492 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
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SH3BP1-207ENST00000471650 H0Y858 1186 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 M0R296 226 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 TBX3O15119 743 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 NEMFO60524 1076 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 ATP9AO75110 1047 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 CYP2C9P11712 490 aa12.12□□□□□ -0.47
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SH3BP1-207ENST00000471650 TNFAIP2Q03169 654 aa12.12□□□□□ -0.47
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SH3BP1-207ENST00000471650 LY6KQ17RY6 165 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 GNASQ5JWF2 1037 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM63BQ5T3F8 832 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 ATL3Q6DD88 541 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 POTEDQ86YR6 584 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 RNF135Q8IUD6 432 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 EDAQ92838 391 aa12.12□□□□□ -0.47
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SH3BP1-207ENST00000471650 MTMR9Q96QG7 549 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF577Q9BSK1 485 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM60Q9H2L4 133 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 KCNMB3Q9NPA1 279 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 TLR9Q9NR96 1032 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 CLIC4Q9Y696 253 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 NFASCO94856 1347 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-207ENST00000471650 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa12.11□□□□□ -0.47
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