RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468380.1

LINC00888-201, long intergenic non-protein coding RNA 888, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00888, Length 1,241 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00888-201ENST00000468380 S1PR5Q9H228 398 aa21.47■■□□□ 1.03
LINC00888-201ENST00000468380 SPTBN4Q9H254 2564 aa21.47■■□□□ 1.03
LINC00888-201ENST00000468380 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.47■■□□□ 1.03
LINC00888-201ENST00000468380 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.46■■□□□ 1.03
LINC00888-201ENST00000468380 H0Y858 1186 aa21.46■■□□□ 1.03
LINC00888-201ENST00000468380 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
LINC00888-201ENST00000468380 DUSP6Q16828 381 aa21.46■■□□□ 1.03
LINC00888-201ENST00000468380 TMEM266Q2M3C6 531 aa21.46■■□□□ 1.03
LINC00888-201ENST00000468380 CUL5Q93034 780 aa21.46■■□□□ 1.03
LINC00888-201ENST00000468380 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
LINC00888-201ENST00000468380 TLR9Q9NR96 1032 aa21.46■■□□□ 1.03
LINC00888-201ENST00000468380 HCSTQ9UBK5 93 aa21.46■■□□□ 1.03
LINC00888-201ENST00000468380 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.46■■□□□ 1.03
LINC00888-201ENST00000468380 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.46■■□□□ 1.03
LINC00888-201ENST00000468380 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.46■■□□□ 1.03
LINC00888-201ENST00000468380 MGEA5O60502 916 aa21.45■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 CYP21A2P08686 494 aa21.45■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 PAK2Q13177 524 aa21.45■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 KCNC3Q14003 757 aa21.45■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 WTAPQ15007 396 aa21.45■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 PTPN21Q16825 1174 aa21.45■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.45■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 FSCN2O14926 492 aa21.44■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 FGF18O76093 207 aa21.44■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 NUCB1Q02818 461 aa21.44■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 TRDNQ13061 729 aa21.44■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.44■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 SYCE2Q6PIF2 218 aa21.44■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.44■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 CDHR1Q96JP9 859 aa21.44■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 APOL5Q9BWW9 433 aa21.44■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 CDHR5Q9HBB8 845 aa21.44■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.44■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 IGHDP01880 384 aa21.43■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 PTH1RQ03431 593 aa21.43■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 UBE3AQ05086 875 aa21.43■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 PLCB4Q15147 1175 aa21.43■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa21.43■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 RIPOR3Q96MK2 946 aa21.43■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 NEK1Q96PY6 1258 aa21.43■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 MYL10Q9BUA6 226 aa21.43■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.43■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 JADE2Q9NQC1 790 aa21.43■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.43■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 PLXNA3P51805 1871 aa21.43■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 ERICH2A1L162 156 aa21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 M0QZ92 97 aa21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 ANTXR2P58335 489 aa21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 MTMR1Q13613 665 aa21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 ANKRD54Q6NXT1 300 aa21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 TMEM260Q9NX78 707 aa21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 CDH22Q9UJ99 828 aa21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.42■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 MYO10Q9HD67 2058 aa21.41■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 DMDP11532 3685 aa21.41■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 PROB1E7EW31 1015 aa21.41■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 TECP42680 631 aa21.41■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 KRT76Q01546 638 aa21.41■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 APOBRQ0VD83 1088 aa21.41■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 UBE2SQ16763 222 aa21.41■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.41■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa21.41■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 CWH43Q9H720 699 aa21.41■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 TRPC6Q9Y210 931 aa21.41■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.4■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 E7EWF7 191 aa21.4■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.4■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 NME8Q8N427 588 aa21.4■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.4■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.4■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.4■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 ADAM2Q99965 735 aa21.4■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 AAASQ9NRG9 546 aa21.4■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.4■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
LINC00888-201ENST00000468380 C9IYK1 514 aa21.39■■□□□ 1.01
LINC00888-201ENST00000468380 MAFGO15525 162 aa21.39■■□□□ 1.01
LINC00888-201ENST00000468380 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
LINC00888-201ENST00000468380 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.39■■□□□ 1.01
LINC00888-201ENST00000468380 SMARCA1P28370 1054 aa21.39■■□□□ 1.01
LINC00888-201ENST00000468380 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.39■■□□□ 1.01
LINC00888-201ENST00000468380 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms