RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SCN4AP35499 1836 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ASTN1O14525 1302 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 RSPH10B2B2RC85 870 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 C19orf81C9J6K1 198 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PDXKO00764 312 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TGFB1I1O43294 461 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZSCAN12O43309 604 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 NOL4O94818 638 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 STBD1O95210 358 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 LCA5LO95447 670 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 RSPH10BP0C881 870 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 GAP43P17677 238 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 KRT9P35527 623 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 KLK7P49862 253 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 HERVK_113P62684 666 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZBED6P86452 979 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 UBXN1Q04323 297 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 KCNMA1Q12791 1236 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PGM5Q15124 567 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TKFCQ3LXA3 575 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 VWA3BQ502W6 1294 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SFR1Q86XK3 245 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 NEK9Q8TD19 979 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TSC1Q92574 1164 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ATG4CQ96DT6 458 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 DYDC2Q96IM9 177 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 UIMC1Q96RL1 719 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 WDR24Q96S15 920 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 CHP1Q99653 195 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 DESI2Q9BSY9 194 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 NDST4Q9H3R1 872 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 DMAC2Q9NW81 257 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 GGA3Q9NZ52 723 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 KCND2Q9NZV8 630 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 DNM3Q9UQ16 869 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 RIPK3Q9Y572 518 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PFASO15067 1338 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 UBE4BO95155 1302 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 IRF6O14896 467 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF263O14978 683 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB39O15060 712 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 NRDCO43847 1150 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 FLOT1O75955 427 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 CCNE2O96020 404 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ABL1P00519 1130 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC175P0C221 793 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 MYBP10242 640 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 IDEP14735 1019 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 UBXN2AP68543 259 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 MAP3K9P80192 1104 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 CYP4A11Q02928 519 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 MOGSQ13724 837 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 HGSNATQ68CP4 663 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 LBX2Q6XYB7 198 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 KIF18AQ8NI77 898 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 OLIG1Q8TAK6 271 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 KCNN1Q92952 543 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 NACC1Q96RE7 527 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 WRNIP1Q96S55 665 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 FEZ1Q99689 392 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 NUP58Q9BVL2 599 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 GANQ9H2C0 597 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms