RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 RMND1Q9NWS8 449 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM49BA6NDI0 452 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 VEGFBP49765 207 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 PSMC5P62195 406 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 ANO5Q75V66 913 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 EEF2KMTQ96G04 330 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 TINF2Q9BSI4 451 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 FANCLQ9NW38 375 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 TRPA1O75762 1119 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 CAVIN2O95810 425 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP1A3P13637 1013 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP4AP20648 1035 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 MAP2K5Q13163 448 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 PCYT2Q99447 389 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 BPIFA3Q9BQP9 254 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 GJD2Q9UKL4 321 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 PSAPP07602 524 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 TGFB3P10600 412 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 UVSSAQ2YD98 709 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM50Q86XT4 487 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 ADCY6O43306 1168 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 RRP9O43818 475 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 STBD1O95210 358 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP2C19P33261 490 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 RARRES1P49788 294 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 NEDD9Q14511 834 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 NEK9Q8TD19 979 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 MGAMO43451 1857 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 EHHADHQ08426 723 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 ADSSL1Q8N142 457 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM47Q96LD4 638 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 MYH11P35749 1972 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 PSMC4P43686 418 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 SOX10P56693 466 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 MYL5Q02045 173 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 PADI6Q6TGC4 694 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 METTL7BQ6UX53 244 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 C4orf19Q8IY42 314 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 NELFBQ8WX92 580 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 GABRQQ9UN88 632 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 ATG7O95352 703 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 CASP5P51878 434 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 XKR9Q5GH70 373 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 SFR1Q86XK3 245 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 SCFD2Q8WU76 684 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 USP6NLQ92738 828 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 SPATA33Q96N06 139 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 ADCY5O95622 1261 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 PRKCEQ02156 737 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 TTLL4Q14679 1199 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 MUTP22033 750 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 GPR20Q99678 358 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF302Q9NR11 478 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 MARK3P27448 753 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 ACVR2BQ13705 512 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 RDM1Q8NG50 284 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 DACH1Q9UI36 760 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-204ENST00000452765 LYPLA2O95372 231 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-204ENST00000452765 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC173Q0VFZ6 552 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC144BQ3MJ40 725 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-204ENST00000452765 DAW1Q8N136 415 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-204ENST00000452765 VTA1Q9NP79 307 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-204ENST00000452765 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-204ENST00000452765 FRMD3A2A2Y4 597 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-204ENST00000452765 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-204ENST00000452765 IKBKBO14920 756 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-204ENST00000452765 SMPD1P17405 629 aa23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms