RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		15.34	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLIN2	Q99541	437 aa		15.34	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		15.34	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		15.34	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	HAS3	O00219	553 aa		15.33	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	OAT	P04181	439 aa		15.33	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		15.33	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		15.33	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		15.33	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	COL6A1	P12109	1028 aa		15.33	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	TXLNA	P40222	546 aa		15.33	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		15.33	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		15.33	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		15.33	■□□□□ 0.05
SELENBP1-208	ENST00000447402	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TCHH	Q07283	1943 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRIN2D	O15399	1336 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM150B	A6NC51	233 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARVCF	O00192	962 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZBTB39	O15060	712 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	HBP1	O60381	514 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAPN15	O75808	1086 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	INSRR	P14616	1297 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPFIA1	Q13136	1202 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ECM1	Q16610	540 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	XKR3	Q5GH77	459 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	POTEG	Q6S5H5	508 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	USP49	Q70CQ1	688 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	C4orf19	Q8IY42	314 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CALML4	Q96GE6	196 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM167A	Q96KS9	214 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PANK2	Q9BZ23	570 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SETD4	Q9NVD3	440 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		15.32	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		15.32	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		15.32	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	NOD1	Q9Y239	953 aa		15.32	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		15.32	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	NRCAM	Q92823	1304 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	GNAT1	P11488	350 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRIK4	Q16099	956 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	MTERF2	Q49AM1	385 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADAL	Q6DHV7	355 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SHC4	Q6S5L8	630 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANO5	Q75V66	913 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	NACC1	Q96RE7	527 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNM3	Q9UQ16	869 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	MUT	P22033	750 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	NPEPPS	P55786	919 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRB10	Q13322	594 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM60	Q495X7	471 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	XKR9	Q5GH70	373 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDILT	Q8N807	584 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CEP170P1	Q96L14	293 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		15.29	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		15.29	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		15.29	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402		E9PMD0	336 aa		15.29	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	STBD1	O95210	358 aa		15.29	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	LYPLA2	O95372	231 aa		15.29	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDK7	P50613	346 aa		15.29	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	RTP1	P59025	263 aa		15.29	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	15.29	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTGIS	Q16647	500 aa		15.29	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		15.29	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		15.29	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		15.29	■□□□□ 0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	GBP4	Q96PP9	640 aa		15.29	■□□□□ 0.04

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