RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436228.6

SPDYE2B-201, Transcript of speedy/RINGO cell cycle regulator family member E2B, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPDYE2B, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2B-201ENST00000436228 PRPHP41219 470 aa18.71■□□□□ 0.59
SPDYE2B-201ENST00000436228 TECP42680 631 aa18.71■□□□□ 0.59
SPDYE2B-201ENST00000436228 PSMC5P62195 406 aa18.71■□□□□ 0.59
SPDYE2B-201ENST00000436228 BFSP2Q13515 415 aa18.71■□□□□ 0.59
SPDYE2B-201ENST00000436228 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SPDYE2B-201ENST00000436228 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.71■□□□□ 0.59
SPDYE2B-201ENST00000436228 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SPDYE2B-201ENST00000436228 NEK9Q8TD19 979 aa18.71■□□□□ 0.59
SPDYE2B-201ENST00000436228 ATP8B4Q8TF62 1192 aa18.71■□□□□ 0.59
SPDYE2B-201ENST00000436228 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SPDYE2B-201ENST00000436228 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SPDYE2B-201ENST00000436228 SETD4Q9NVD3 440 aa18.71■□□□□ 0.59
SPDYE2B-201ENST00000436228 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa18.71■□□□□ 0.59
SPDYE2B-201ENST00000436228 EML1O00423 815 aa18.7■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 F13A1P00488 732 aa18.7■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 QARSP47897 775 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 IGBP1P78318 339 aa18.7■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 GRIK4Q16099 956 aa18.7■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 C9orf50Q5SZB4 431 aa18.7■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 C4orf32Q8N8J7 132 aa18.7■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 RETREG2Q8NC44 543 aa18.7■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 BANK1Q8NDB2 785 aa18.7■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 IL23AQ9NPF7 189 aa18.7■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 STK24Q9Y6E0 443 aa18.7■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 POTEMA6NI47 508 aa18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 OATP04181 439 aa18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 PFKMP08237 780 aa18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 INSRRP14616 1297 aa18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 CSF2RAP15509 400 aa18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 CYP2C18P33260 490 aa18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 PRKCEQ02156 737 aa18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 SPIRE1Q08AE8 756 aa18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF484Q5JVG2 852 aa18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 LMBR1Q8WVP7 490 aa18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 LRWD1Q9UFC0 647 aa18.69■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 COL1A2P08123 1366 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 PITPNM1O00562 1244 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 CYP2C9P11712 490 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 RFC2P35250 354 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 PTK7Q13308 1070 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 PDIA5Q14554 519 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 UGCGQ16739 394 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 XKR3Q5GH77 459 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 HAUS3Q68CZ6 603 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 FAM173BQ6P4H8 233 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 TPH2Q8IWU9 490 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 CAGE1Q8TC20 777 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 DYDC2Q96IM9 177 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 LXNQ9BS40 222 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 TUBE1Q9UJT0 475 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 DNAH12Q6ZR08 3092 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 WDR81Q562E7 1941 aa18.68■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 DDX11L8A8MPP1 907 aa18.67■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 EPHB4P54760 987 aa18.67■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 CYP4A11Q02928 519 aa18.67■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF697Q5TEC3 545 aa18.67■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 DEFB123Q8N688 67 aa18.67■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP18.67■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 RGL1Q9NZL6 768 aa18.67■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 CLIC4Q9Y696 253 aa18.67■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 VWA3AA6NCI4 1184 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 TREHO43280 583 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF862O60290 1169 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 PARNO95453 639 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 FGBP02675 491 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 ATP4AP20648 1035 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 HOXC8P31273 242 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 CCL23P55773 120 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 NUCB2P80303 420 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 PKP1Q13835 747 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 STK38Q15208 465 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 TMEM240Q5SV17 173 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 TAF2Q6P1X5 1199 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 OTUD6AQ7L8S5 288 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 RSPH3Q86UC2 560 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 C4orf19Q8IY42 314 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 TUFT1Q9NNX1 390 aa18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 TMEM265A0A087WTH1 108 aa18.65■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 BRD1O95696 1058 aa18.65■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 ACTN1P12814 892 aa18.65■□□□□ 0.58
SPDYE2B-201ENST00000436228 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms