RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

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Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EXOC2Q96KP1 924 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 JAM3Q9BX67 310 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PATE3B3GLJ2 98 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KLHL18O94889 574 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAPGEF3O95398 923 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C6P13671 934 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NAT1P18440 290 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GABREP78334 506 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM209AQ5JX71 171 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 USP53Q70EK8 1073 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPRED1Q7Z699 444 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATL2Q8NHH9 583 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 B4E1Z4 1266 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 B4GALT4O60513 344 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FSHBP01225 129 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TACR2P21452 398 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RNF180Q86T96 592 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DCAF4Q8WV16 495 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NUDT11Q96G61 164 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 JADE2Q9NQC1 790 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRODHO43272 600 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAHP16930 419 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GRK2P25098 689 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GRK3P35626 688 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SELENOPP49908 381 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EPHB1P54762 984 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GRIN1Q05586 938 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KIZQ2M2Z5 673 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LBX2Q6XYB7 198 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 Q6ZUG5 572 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PTPN18Q99952 460 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KNG1P01042 644 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ASLP04424 464 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TUSC3Q13454 348 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 Q8N1X5 172 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PTPRN2Q92932 1015 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AJUBAQ96IF1 538 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DEF6Q9H4E7 631 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCND1Q9NSA2 647 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BRINP1O60477 761 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CKMP06732 381 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GDF5P43026 501 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EPHA5P54756 1037 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DHCR24Q15392 516 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PSMD1Q99460 953 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYR61O00622 381 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF623O75123 536 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FBXO21O94952 628 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GNAT1P11488 350 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACVRL1P37023 503 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GUCY2FP51841 1108 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPR85P60893 370 aa6.63□□□□□ -1.35
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