RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429159.6

MEG3-208, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,608 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-208ENST00000429159 PADI6Q6TGC4 694 aa20.64■□□□□ 0.9
MEG3-208ENST00000429159 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.64■□□□□ 0.9
MEG3-208ENST00000429159 MYCT1Q8N699 235 aa20.64■□□□□ 0.9
MEG3-208ENST00000429159 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.64■□□□□ 0.9
MEG3-208ENST00000429159 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.64■□□□□ 0.9
MEG3-208ENST00000429159 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.64■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 GNA14O95837 355 aa20.64■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 CCNE2O96020 404 aa20.64■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 CST9Q5W186 159 aa20.64■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 SFR1Q86XK3 245 aa20.64■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.64■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.64■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 UBE4BO95155 1302 aa20.63■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 LCTP09848 1927 aa20.63■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 PEX10O60683 326 aa20.63■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 RARRES1P49788 294 aa20.63■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ACTR2P61160 394 aa20.63■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.63■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 DRC1Q96MC2 740 aa20.63■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 CEP63Q96MT8 703 aa20.63■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.63■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 COBLO75128 1261 aa20.62■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ZNF131P52739 623 aa20.62■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 INHBEP58166 350 aa20.62■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ALCAMQ13740 583 aa20.62■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 LRRC41Q15345 812 aa20.62■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.62■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.62■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.62■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.62■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.62■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 BACH1O14867 736 aa20.61■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 GCNT3O95395 438 aa20.61■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 TRIM14Q14142 442 aa20.61■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.61■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.61■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.61■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.61■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.61■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.61■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ASTN1O14525 1302 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 PGK2P07205 417 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 MAPK4P31152 587 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 XKR9Q5GH70 373 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ODR4Q5SWX8 454 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 MORC4Q8TE76 937 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 VPS16Q9H269 839 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 PDXKO00764 312 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ZBTB39O15060 712 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 DNM2P50570 870 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 SWSAP1Q6NVH7 229 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 RGMBQ6NW40 437 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 EFCC1Q9HA90 598 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.6■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 LGALS16A8MUM7 142 aa20.59■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 CETN3O15182 167 aa20.59■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 HIP1RO75146 1068 aa20.59■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ATG7O95352 703 aa20.59■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 UBXN1Q04323 297 aa20.59■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 XKR3Q5GH77 459 aa20.59■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 METTL7BQ6UX53 244 aa20.59■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.59■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.59■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.59■□□□□ 0.89
MEG3-208ENST00000429159 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms