RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 GPBP1Q86WP2 473 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SPC24Q8NBT2 197 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 NEK9Q8TD19 979 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 LRRC15Q8TF66 581 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 NELFBQ8WX92 580 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 HLA-CQ95604 372 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC102AQ96A19 550 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 OPTNQ96CV9 577 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 WNK4Q96J92 1243 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D22BQ9NU19 505 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 IFNKQ9P0W0 207 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 PFASO15067 1338 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 B4DLN1 442 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 E9PMD0 336 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CHMP2AO43633 222 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 STAM2O75886 525 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 KIF20AO95235 890 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 EYA4O95677 639 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SLC25A27O95847 323 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 NR3C2P08235 984 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 IDEP14735 1019 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 PRCPP42785 496 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 STX17P56962 302 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 HERVK_113P62684 666 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ECM1Q16610 540 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 GNPTABQ3T906 1256 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 DYMQ7RTS9 669 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 KCNK18Q7Z418 384 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 TPH2Q8IWU9 490 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ADSSL1Q8N142 457 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ANKRD35Q8N283 1001 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 C2orf69Q8N8R5 385 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 GPRASP2Q96D09 838 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CDHR1Q96JP9 859 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 NACC1Q96RE7 527 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CTAGE1Q96RT6 745 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 IWS1Q96ST2 819 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 HSD17B14Q9BPX1 270 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 UNC45AQ9H3U1 944 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 RRAGCQ9HB90 399 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CYP39A1Q9NYL5 469 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 GDAQ9Y2T3 454 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MYH15Q9Y2K3 1946 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 EML1O00423 815 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 TRAF5O00463 557 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 HOXA2O43364 376 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 TBCAO75347 108 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CETPP11597 493 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ATP1A3P13637 1013 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF18P17022 549 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CCNE1P24864 410 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CLCN1P35523 988 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 JAK3P52333 1124 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 GTF2A2P52657 109 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SLC12A3P55017 1021 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 GSDMDP57764 484 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 KRT76Q01546 638 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CYP4A11Q02928 519 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 STXBP2Q15833 593 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC186Q7Z3E2 898 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 TMC6Q7Z403 805 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 FAM43AQ8N2R8 423 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 DNERQ8NFT8 737 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 IL31RAQ8NI17 732 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 DYDC2Q96IM9 177 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM47Q96LD4 638 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms