RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 NEK9Q8TD19 979 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ANXA13P27216 316 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ATP1A2P50993 1020 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 GDAQ9Y2T3 454 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 AGLP35573 1532 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 STAT3P40763 770 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 GNGT1P63211 74 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 CYP27A1Q02318 531 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 TTLL4Q14679 1199 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 VSTM4Q8IW00 320 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 EFCAB13Q8IY85 973 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 OTUD5Q96G74 571 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 IQCA1LA6NCM1 817 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 NDUFA10O95299 355 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ECEL1O95672 775 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 SFNP31947 248 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 GRM4Q14833 912 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ERICH1Q86X53 443 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 LY9Q9HBG7 655 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 MED4Q9NPJ6 270 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 RFX7Q2KHR2 1363 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 P4HBP07237 508 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 MYL3P08590 195 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 PHKA2P46019 1235 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 QARSP47897 775 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 PLTPP55058 493 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 FOXO4P98177 505 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 CSPG5O95196 566 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 KRT10P13645 584 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 DYNLT1P63172 113 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 SNX1Q13596 522 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 KRT31Q15323 416 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 TCP11X2Q5H9J9 407 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 RESP18Q5W5W9 173 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 LMNTD2Q8IXW0 634 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 KCTD6Q8NC69 237 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 CRAMP1Q96RY5 1269 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 TTC1Q99614 292 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ACAD9Q9H845 621 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 GLI2P10070 1586 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ORC4O43929 436 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 FTCDO95954 541 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 PBKQ96KB5 322 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 EPB41L5Q9HCM4 733 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ATP1A3P13637 1013 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 BASP1P80723 227 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 CYP4F22Q6NT55 531 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 RAPH1Q70E73 1250 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 SFR1Q86XK3 245 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 SPTLC3Q9NUV7 552 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 BARHL2Q9NY43 387 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ZNRF3Q9ULT6 936 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 E9PMD0 336 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 TNFAIP2Q03169 654 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ARL13BQ3SXY8 428 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF449Q6P9G9 518 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 HDAC11Q96DB2 347 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 EFCC1Q9HA90 598 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 WDR46O15213 610 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 CPP00450 1065 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 SCARF1Q14162 830 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 SGMS1Q86VZ5 419 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 RHOT2Q8IXI1 618 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-202ENST00000366197 PROM2Q8N271 834 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms