RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366170.6

VSTM1-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSTM1, Length 654 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1-202ENST00000366170 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 PCYT2Q99447 389 aa14.5□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.5□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 PCNTO95613 3336 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 CTAGE5O15320 804 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 ZEB2O60315 1214 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 KPNA6O60684 536 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 LYPLA2O95372 231 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 EYA4O95677 639 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 MMP3P08254 477 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 MYL3P08590 195 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 PLA2G4BP0C869 781 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 AFMP43652 599 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 GJA9P57773 515 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 BEX3Q00994 111 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 MCM6Q14566 821 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 XKR9Q5GH70 373 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 XKR3Q5GH77 459 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 GNASQ5JWF2 1037 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 KCNK18Q7Z418 384 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 STAMQ92783 540 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 PAGE5Q96GU1 130 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 TNMDQ9H2S6 317 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.48□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 ZBTB39O15060 712 aa14.48□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 PGK1P00558 417 aa14.48□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 LGALS2P05162 132 aa14.48□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 SLC26A2P50443 739 aa14.48□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.48□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.48□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.48□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 EMSYQ7Z589 1322 aa14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 H3BRB1 525 aa14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 ZNF862O60290 1169 aa14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 OATP04181 439 aa14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 MARK3P27448 753 aa14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 RNF180Q86T96 592 aa14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 FAM167AQ96KS9 214 aa14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 KAT6AQ92794 2004 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 HBP1O60381 514 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 STBD1O95210 358 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 CCL5P13501 91 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 ATP4AP20648 1035 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 CHMP4BP1P59074 171 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 NKX3-2P78367 333 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 PRKCEQ02156 737 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 POSTNQ15063 836 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 GPBP1Q86WP2 473 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 TRIM50Q86XT4 487 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 LRRC15Q8TF66 581 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 CEP170P1Q96L14 293 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 RNF208Q9H0X6 261 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 TRPC6Q9Y210 931 aa14.46□□□□□ -0.09
VSTM1-202ENST00000366170 SMC2O95347 1197 aa14.45□□□□□ -0.1
VSTM1-202ENST00000366170 ZNF286BP0CG31 522 aa14.45□□□□□ -0.1
VSTM1-202ENST00000366170 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
VSTM1-202ENST00000366170 SLC12A3P55017 1021 aa14.45□□□□□ -0.1
VSTM1-202ENST00000366170 NPEPPSP55786 919 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms