RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 XKR3Q5GH77 459 aa30.02■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 IGSF22Q8N9C0 903 aa30.02■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 DYDC2Q96IM9 177 aa30.02■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa30.02■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 EVPLQ92817 2033 aa30.02■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 SLITRK3O94933 977 aa30.01■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 NUCB2P80303 420 aa30.01■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 PRKCEQ02156 737 aa30.01■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 TPH2Q8IWU9 490 aa30.01■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 C4orf19Q8IY42 314 aa30.01■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 LMBR1Q8WVP7 490 aa30.01■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 RGL1Q9NZL6 768 aa30.01■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 TBX21Q9UL17 535 aa30.01■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 ZDHHC9Q9Y397 364 aa30.01■■■□□ 2.4
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM43BA6NCK2 446 aa30■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 HIC1Q14526 733 aa30■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 PTPAQ15257 358 aa30■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 IL17AQ16552 155 aa30■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa30■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC155Q8N6L0 562 aa30■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 USP28Q96RU2 1077 aa30■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 LXNQ9BS40 222 aa30■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 TUFT1Q9NNX1 390 aa30■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa30■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 TREHO43280 583 aa29.99■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 HAUS3Q68CZ6 603 aa29.99■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 SERINC5Q86VE9 423 aa29.99■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 CTAGE1Q96RT6 745 aa29.99■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 CEP290O15078 2479 aa29.99■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 VWA3AA6NCI4 1184 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 DDX11L8A8MPP1 907 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 LYPLA2O95372 231 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 CYP2C9P11712 490 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 RAG1P15918 1043 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 MUTP22033 750 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 RPA1P27694 616 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 IGBP1P78318 339 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 CYP4A11Q02928 519 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 BFSP2Q13515 415 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 SLC39A14Q15043 492 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 MARCH8Q5T0T0 291 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 OTUD6AQ7L8S5 288 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 HIPK3Q9H422 1215 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 TUBE1Q9UJT0 475 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 CFAP45Q9UL16 551 aa29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 STBD1O95210 358 aa29.97■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 TIMP1P01033 207 aa29.97■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 DDIT3P35638 169 aa29.97■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 NASPP49321 788 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 CAGE1Q8TC20 777 aa29.97■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 AK8Q96MA6 479 aa29.97■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP29.97■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 TCHHQ07283 1943 aa29.97■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 SYN1P17600 705 aa29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 KLRC1P26715 233 aa29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 KRT79Q5XKE5 535 aa29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 TAF2Q6P1X5 1199 aa29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 CATSPER3Q86XQ3 398 aa29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 RETREG2Q8NC44 543 aa29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 PITPNM1O00562 1244 aa29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 MAGEB2O15479 319 aa29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 LONP1P36776 959 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 STK38Q15208 465 aa29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 MTHFD1LQ6UB35 978 aa29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 PPME1Q9Y570 386 aa29.96■■■□□ 2.39
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB42B2RXF5 422 aa29.95■■■□□ 2.38
CRIP1-201ENST00000330233 YEATS4O95619 227 aa29.95■■■□□ 2.38
CRIP1-201ENST00000330233 YWHABP31946 246 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
CRIP1-201ENST00000330233 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
CRIP1-201ENST00000330233 ANO5Q75V66 913 aa29.95■■■□□ 2.38
CRIP1-201ENST00000330233 LINC00301Q8NCQ3 95 aa29.95■■■□□ 2.38
CRIP1-201ENST00000330233 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa29.95■■■□□ 2.38
CRIP1-201ENST00000330233 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
CRIP1-201ENST00000330233 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
CRIP1-201ENST00000330233 H0YGN5 161 aa29.94■■■□□ 2.38
CRIP1-201ENST00000330233 MED24O75448 989 aa29.94■■■□□ 2.38
CRIP1-201ENST00000330233 RBL2Q08999 1139 aa29.94■■■□□ 2.38
CRIP1-201ENST00000330233 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CRIP1-201ENST00000330233 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms