RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.08■■□□□ 1.13
HPS6-201ENST00000299238 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 SNX1Q13596 522 aa22.08■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 SPA17Q15506 151 aa22.08■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 HYIQ5T013 277 aa22.08■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 SPDL1Q96EA4 605 aa22.08■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.08■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.08■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.08■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 ENO4A6NNW6 628 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 OPLAHO14841 1288 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 GDF11O95390 407 aa22.07■■□□□ 1.12
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HPS6-201ENST00000299238 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 RRAGAQ7L523 313 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 LRRC53A6NM62 1247 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 KIF11P52732 1056 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 MYH10P35580 1976 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 MOCS3O95396 460 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 MCM3P25205 808 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 CHRNA5P30532 468 aa22.06■■□□□ 1.12
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HPS6-201ENST00000299238 AOC3Q16853 763 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 FUKQ8N0W3 1084 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 ANO3Q9BYT9 981 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 SH2D4AQ9H788 454 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
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HPS6-201ENST00000299238 CXCR5P32302 372 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 LSP1P33241 339 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 SKOR1P84550 965 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 APBA1Q02410 837 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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HPS6-201ENST00000299238 CCDC114Q96M63 670 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 TSG101Q99816 390 aa22.06■■□□□ 1.12
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HPS6-201ENST00000299238 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.05■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 EHD2Q9NZN4 543 aa22.05■■□□□ 1.12
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HPS6-201ENST00000299238 CAND2O75155 1236 aa22.05■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 SH3GL3Q99963 347 aa22.05■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.05■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.05■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 AKR1B10O60218 316 aa22.04■■□□□ 1.12
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HPS6-201ENST00000299238 KCNMA1Q12791 1236 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 ARMC3Q5W041 872 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 TRIM58Q8NG06 486 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 PANK4Q9NVE7 773 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 PDXDC1Q6P996 788 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 F5H6K3 240 aa22.03■■□□□ 1.12
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HPS6-201ENST00000299238 SNAP25P60880 206 aa22.03■■□□□ 1.12
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HPS6-201ENST00000299238 KLRC3Q07444 240 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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HPS6-201ENST00000299238 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.03■■□□□ 1.12
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HPS6-201ENST00000299238 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 SNX12Q9UMY4 172 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 E9PMD0 336 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 MEIS2O14770 477 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 KRT14P02533 472 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS6-201ENST00000299238 SSR1P43307 286 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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