RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293604.10

C6orf136-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 136, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C6orf136, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136-201ENST00000293604 ALS2CLQ60I27 953 aa23.99■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.99■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 DDX12PQ92771 950 aa23.99■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.99■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.99■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 A6NNZ2 444 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 POLR2MP0CAP2 368 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 MARSP56192 900 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 TUBB8Q3ZCM7 444 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 PRR16Q569H4 304 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 ERMNQ8TAM6 284 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 LENG9Q96B70 501 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 SH3GL2Q99962 352 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 STIM2Q9P246 746 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 ZMYND10O75800 440 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 EGFRP00533 1210 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 EPB41P11171 864 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 PTGER2P43116 358 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 RASSF7Q02833 373 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 DYMQ7RTS9 669 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 HOOK2Q96ED9 719 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 LRRC1Q9BTT6 524 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 LCMT1Q9UIC8 334 aa23.98■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 GOLGA6CA6NDK9 693 aa23.97■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 SERPING1P05155 500 aa23.97■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 GOLGA6DP0CG33 693 aa23.97■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 PPFIA1Q13136 1202 aa23.97■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 HGSNATQ68CP4 663 aa23.97■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa23.97■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 CCDC174Q6PII3 467 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 FAM107BQ9H098 131 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 HACL1Q9UJ83 578 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 FAM86B1E9PN63 330 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 COASYQ13057 564 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 SFMBT2Q5VUG0 894 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 DCAF15Q66K64 600 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 KCNK18Q7Z418 384 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 TLR10Q9BXR5 811 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf136-201ENST00000293604 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.95■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 CFBP00751 764 aa23.95■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 ZNF76P36508 570 aa23.95■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 KCNMA1Q12791 1236 aa23.95■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 ECM1Q16610 540 aa23.95■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 APBA1Q02410 837 aa23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 LDHDQ86WU2 507 aa23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 GJA10Q969M2 543 aa23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 ICAM1P05362 532 aa23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 MAGEA9P43362 315 aa23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 PRELPP51888 382 aa23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 CCDC40Q4G0X9 1142 aa23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 C8orf74Q6P047 294 aa23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 DRC1Q96MC2 740 aa23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 PNMA2Q9UL42 364 aa23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.94■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 RPA1P27694 616 aa23.93■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 CORO7P57737 925 aa23.93■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.93■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.93■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 C10orf67Q8IYJ2 551 aa23.93■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 PANK4Q9NVE7 773 aa23.93■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 MSH4O15457 936 aa23.92■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 DOCK1Q14185 1865 aa23.92■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 NAB2Q15742 525 aa23.92■■□□□ 1.42
C6orf136-201ENST00000293604 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.1 ms