RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287820.10

PPARG-201, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPARG, Length 1,850 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-201ENST00000287820 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PPARG-201ENST00000287820 GUCY1B3Q02153 619 aa9.51□□□□□ -0.89
PPARG-201ENST00000287820 MBTPS1Q14703 1052 aa9.51□□□□□ -0.89
PPARG-201ENST00000287820 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
PPARG-201ENST00000287820 FAM26DQ5JW98 314 aa9.51□□□□□ -0.89
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PPARG-201ENST00000287820 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.51□□□□□ -0.89
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PPARG-201ENST00000287820 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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PPARG-201ENST00000287820 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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PPARG-201ENST00000287820 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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PPARG-201ENST00000287820 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.898e-6■■■■□ 25
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PPARG-201ENST00000287820 COL1A2P08123 1366 aa9.48□□□□□ -0.89
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PPARG-201ENST00000287820 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.48□□□□□ -0.89
PPARG-201ENST00000287820 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PPARG-201ENST00000287820 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.48□□□□□ -0.89
PPARG-201ENST00000287820 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.47□□□□□ -0.89
PPARG-201ENST00000287820 MAGEB2O15479 319 aa9.47□□□□□ -0.89
PPARG-201ENST00000287820 OATP04181 439 aa9.47□□□□□ -0.89
PPARG-201ENST00000287820 CTSHP09668 335 aa9.47□□□□□ -0.89
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